Protein–RNA interactions for Protein: O35892

Sp100, Nuclear autoantigen Sp-100, mousemouse

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Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp100O35892 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sp100O35892 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sp100O35892 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sp100O35892 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Sp100O35892 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sp100O35892 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sp100O35892 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sp100O35892 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Sp100O35892 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sp100O35892 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Sp100O35892 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sp100O35892 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sp100O35892 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sp100O35892 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sp100O35892 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sp100O35892 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sp100O35892 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sp100O35892 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Sp100O35892 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sp100O35892 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sp100O35892 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sp100O35892 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Sp100O35892 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sp100O35892 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sp100O35892 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sp100O35892 Pou1f1-201ENSMUST00000004964 1773 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sp100O35892 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sp100O35892 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sp100O35892 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sp100O35892 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sp100O35892 Ugt1a10-201ENSMUST00000113142 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sp100O35892 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sp100O35892 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sp100O35892 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sp100O35892 Brd1-202ENSMUST00000109380 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sp100O35892 Vmn2r-ps25-201ENSMUST00000202322 2321 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
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Sp100O35892 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sp100O35892 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Sp100O35892 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sp100O35892 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Sp100O35892 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sp100O35892 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
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Sp100O35892 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sp100O35892 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sp100O35892 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sp100O35892 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sp100O35892 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
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Sp100O35892 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sp100O35892 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sp100O35892 Zfp174-201ENSMUST00000041778 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sp100O35892 Gm8378-202ENSMUST00000167777 2624 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sp100O35892 Ciita-201ENSMUST00000023147 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sp100O35892 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sp100O35892 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sp100O35892 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sp100O35892 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Sp100O35892 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sp100O35892 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sp100O35892 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sp100O35892 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sp100O35892 Itgal-204ENSMUST00000120857 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
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Sp100O35892 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sp100O35892 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
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Sp100O35892 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sp100O35892 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sp100O35892 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sp100O35892 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sp100O35892 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sp100O35892 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sp100O35892 Gaa-201ENSMUST00000026666 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sp100O35892 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sp100O35892 Myo9a-205ENSMUST00000135298 12198 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sp100O35892 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sp100O35892 Supt16-201ENSMUST00000046709 4673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sp100O35892 Madd-213ENSMUST00000111376 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sp100O35892 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sp100O35892 Madd-206ENSMUST00000099725 5905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sp100O35892 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sp100O35892 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Sp100O35892 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Sp100O35892 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Sp100O35892 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sp100O35892 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sp100O35892 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sp100O35892 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Sp100O35892 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sp100O35892 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sp100O35892 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sp100O35892 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sp100O35892 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sp100O35892 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sp100O35892 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
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