Protein–RNA interactions for Protein: O35599

Opn1mw, Medium-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1mwO35599 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 2010109P13Rik-201ENSMUST00000204605 392 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 Gm18514-201ENSMUST00000218980 436 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 CT030170.2-201ENSMUST00000223267 126 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 Rps10-ps1-201ENSMUST00000074353 495 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 Gm16380-201ENSMUST00000077997 478 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 n-R5s185-201ENSMUST00000083953 119 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 Harbi1-202ENSMUST00000111322 1316 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 Gm43334-201ENSMUST00000197740 1318 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 Nrxn1-215ENSMUST00000173917 1439 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 Tmem39a-204ENSMUST00000163884 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 Tomm5-201ENSMUST00000107807 442 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 Gm13351-201ENSMUST00000118087 414 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 Gm22379-201ENSMUST00000157480 131 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 Gm4862-201ENSMUST00000170405 438 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 Gm43695-201ENSMUST00000196545 196 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 Gm43778-201ENSMUST00000199438 199 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 Gm8436-201ENSMUST00000210152 1080 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 Gm5749-201ENSMUST00000210673 1090 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 Nmi-201ENSMUST00000028314 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 Olfr1163-201ENSMUST00000099835 1043 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 Crygc-202ENSMUST00000114064 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 Rhox3c-202ENSMUST00000115189 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 Gm21987-201ENSMUST00000119704 456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 Gm5257-201ENSMUST00000121823 790 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 2810403D21Rik-208ENSMUST00000153212 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 Gm8723-201ENSMUST00000166076 820 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 Gm8701-201ENSMUST00000169259 874 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 AC238811.4-201ENSMUST00000178019 1246 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 AC238940.3-201ENSMUST00000178830 1246 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 Rhox3a2-204ENSMUST00000184565 823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 1600010M07Rik-202ENSMUST00000188662 654 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.5 ms