Protein–RNA interactions for Protein: J3QPX5

Gm8888, Predicted gene 8888, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8888J3QPX5 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm8888J3QPX5 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm8888J3QPX5 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm8888J3QPX5 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm8888J3QPX5 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm8888J3QPX5 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm8888J3QPX5 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm8888J3QPX5 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm8888J3QPX5 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm8888J3QPX5 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm8888J3QPX5 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm8888J3QPX5 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm8888J3QPX5 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm8888J3QPX5 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm8888J3QPX5 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm8888J3QPX5 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm8888J3QPX5 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm8888J3QPX5 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm8888J3QPX5 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm8888J3QPX5 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm8888J3QPX5 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm8888J3QPX5 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm8888J3QPX5 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm8888J3QPX5 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm8888J3QPX5 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm8888J3QPX5 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm8888J3QPX5 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm8888J3QPX5 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm8888J3QPX5 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm8888J3QPX5 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm8888J3QPX5 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm8888J3QPX5 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm8888J3QPX5 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm8888J3QPX5 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm8888J3QPX5 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm8888J3QPX5 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm8888J3QPX5 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm8888J3QPX5 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm8888J3QPX5 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm8888J3QPX5 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm8888J3QPX5 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm8888J3QPX5 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm8888J3QPX5 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm8888J3QPX5 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm8888J3QPX5 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm8888J3QPX5 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm8888J3QPX5 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm8888J3QPX5 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm8888J3QPX5 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm8888J3QPX5 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm8888J3QPX5 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm8888J3QPX5 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm8888J3QPX5 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm8888J3QPX5 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm8888J3QPX5 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm8888J3QPX5 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm8888J3QPX5 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm8888J3QPX5 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm8888J3QPX5 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm8888J3QPX5 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm8888J3QPX5 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm8888J3QPX5 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm8888J3QPX5 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm8888J3QPX5 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm8888J3QPX5 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm8888J3QPX5 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm8888J3QPX5 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm8888J3QPX5 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm8888J3QPX5 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm8888J3QPX5 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm8888J3QPX5 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm8888J3QPX5 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm8888J3QPX5 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm8888J3QPX5 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm8888J3QPX5 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm8888J3QPX5 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm8888J3QPX5 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm8888J3QPX5 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm8888J3QPX5 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm8888J3QPX5 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm8888J3QPX5 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm8888J3QPX5 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm8888J3QPX5 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm8888J3QPX5 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm8888J3QPX5 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm8888J3QPX5 Tgoln1-201ENSMUST00000070524 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm8888J3QPX5 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm8888J3QPX5 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm8888J3QPX5 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm8888J3QPX5 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm8888J3QPX5 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm8888J3QPX5 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm8888J3QPX5 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm8888J3QPX5 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm8888J3QPX5 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm8888J3QPX5 Tubgcp6-201ENSMUST00000041656 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm8888J3QPX5 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm8888J3QPX5 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm8888J3QPX5 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm8888J3QPX5 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms