Protein–RNA interactions for Protein: J3QPD3

Gm8356, Predicted gene 8356, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8356J3QPD3 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm8356J3QPD3 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm8356J3QPD3 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm8356J3QPD3 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm8356J3QPD3 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm8356J3QPD3 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm8356J3QPD3 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm8356J3QPD3 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm8356J3QPD3 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm8356J3QPD3 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm8356J3QPD3 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm8356J3QPD3 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm8356J3QPD3 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm8356J3QPD3 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm8356J3QPD3 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm8356J3QPD3 Nos1-206ENSMUST00000142742 10123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm8356J3QPD3 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm8356J3QPD3 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm8356J3QPD3 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm8356J3QPD3 Myo18a-208ENSMUST00000108375 7513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm8356J3QPD3 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm8356J3QPD3 Ldb2-204ENSMUST00000199256 2596 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm8356J3QPD3 Hyou1-206ENSMUST00000161318 4489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm8356J3QPD3 Gm44415-201ENSMUST00000204151 2112 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm8356J3QPD3 Tdrd3-202ENSMUST00000168275 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm8356J3QPD3 Gm17029-203ENSMUST00000153443 2758 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm8356J3QPD3 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm8356J3QPD3 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm8356J3QPD3 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm8356J3QPD3 Jmjd4-201ENSMUST00000045279 4315 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm8356J3QPD3 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm8356J3QPD3 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm8356J3QPD3 AI593442-201ENSMUST00000098768 5615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm8356J3QPD3 Scyl2-204ENSMUST00000174252 4817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm8356J3QPD3 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm8356J3QPD3 Tmem134-216ENSMUST00000171743 3701 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm8356J3QPD3 Mthfsd-201ENSMUST00000047282 8312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm8356J3QPD3 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm8356J3QPD3 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm8356J3QPD3 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm8356J3QPD3 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm8356J3QPD3 Eya1-209ENSMUST00000190337 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm8356J3QPD3 Slc45a4-202ENSMUST00000076224 4240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm8356J3QPD3 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm8356J3QPD3 Smg6-201ENSMUST00000045281 5848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm8356J3QPD3 Zfp827-203ENSMUST00000119254 4549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm8356J3QPD3 Atp9b-201ENSMUST00000091790 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm8356J3QPD3 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm8356J3QPD3 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm8356J3QPD3 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm8356J3QPD3 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm8356J3QPD3 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm8356J3QPD3 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm8356J3QPD3 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm8356J3QPD3 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm8356J3QPD3 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm8356J3QPD3 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm8356J3QPD3 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm8356J3QPD3 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm8356J3QPD3 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm8356J3QPD3 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm8356J3QPD3 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm8356J3QPD3 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm8356J3QPD3 Gria1-201ENSMUST00000036315 5546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm8356J3QPD3 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm8356J3QPD3 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm8356J3QPD3 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm8356J3QPD3 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm8356J3QPD3 Odf2l-204ENSMUST00000106192 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm8356J3QPD3 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm8356J3QPD3 Zfp957-201ENSMUST00000040802 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm8356J3QPD3 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm8356J3QPD3 Hpcal4-201ENSMUST00000059667 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm8356J3QPD3 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm8356J3QPD3 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm8356J3QPD3 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm8356J3QPD3 Fn1-203ENSMUST00000186129 7797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm8356J3QPD3 Zmynd8-205ENSMUST00000109266 5072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm8356J3QPD3 Fam198b-202ENSMUST00000118853 6729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm8356J3QPD3 CT010480.4-201ENSMUST00000224654 2283 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm8356J3QPD3 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm8356J3QPD3 Casc1-203ENSMUST00000111728 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm8356J3QPD3 Crebrf-203ENSMUST00000142539 2674 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm8356J3QPD3 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm8356J3QPD3 Gpr146-203ENSMUST00000100514 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm8356J3QPD3 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm8356J3QPD3 Tyw1-202ENSMUST00000044204 4698 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm8356J3QPD3 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm8356J3QPD3 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm8356J3QPD3 Tmcc1-208ENSMUST00000173140 1910 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm8356J3QPD3 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm8356J3QPD3 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm8356J3QPD3 Muc13-201ENSMUST00000023520 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm8356J3QPD3 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm8356J3QPD3 Zfand2a-201ENSMUST00000079996 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm8356J3QPD3 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm8356J3QPD3 Tbc1d14-202ENSMUST00000124036 2765 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm8356J3QPD3 Gm42141-201ENSMUST00000196534 2172 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm8356J3QPD3 Stkld1-201ENSMUST00000055406 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm8356J3QPD3 Rbbp5-202ENSMUST00000187505 1977 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms