Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS6

Gm21818, MCG122238, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21818J3KMS6 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21818J3KMS6 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21818J3KMS6 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21818J3KMS6 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21818J3KMS6 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21818J3KMS6 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21818J3KMS6 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21818J3KMS6 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21818J3KMS6 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21818J3KMS6 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21818J3KMS6 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21818J3KMS6 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21818J3KMS6 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21818J3KMS6 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21818J3KMS6 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21818J3KMS6 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21818J3KMS6 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21818J3KMS6 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21818J3KMS6 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21818J3KMS6 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21818J3KMS6 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21818J3KMS6 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21818J3KMS6 Lama4-201ENSMUST00000019992 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21818J3KMS6 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21818J3KMS6 Scaf1-206ENSMUST00000211735 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21818J3KMS6 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21818J3KMS6 Manea-201ENSMUST00000041374 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21818J3KMS6 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21818J3KMS6 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21818J3KMS6 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21818J3KMS6 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21818J3KMS6 Jade1-201ENSMUST00000026865 5481 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21818J3KMS6 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21818J3KMS6 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21818J3KMS6 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21818J3KMS6 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21818J3KMS6 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21818J3KMS6 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21818J3KMS6 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21818J3KMS6 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21818J3KMS6 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21818J3KMS6 Ppp1r16b-203ENSMUST00000103116 6370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21818J3KMS6 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21818J3KMS6 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Gm21818J3KMS6 Fnbp1l-201ENSMUST00000162409 5198 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21818J3KMS6 Matn2-205ENSMUST00000227759 3569 ntAPPRIS ALT2 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21818J3KMS6 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21818J3KMS6 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21818J3KMS6 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21818J3KMS6 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Gm21818J3KMS6 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21818J3KMS6 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Gm21818J3KMS6 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Gm21818J3KMS6 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21818J3KMS6 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Gm21818J3KMS6 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21818J3KMS6 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21818J3KMS6 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Gm21818J3KMS6 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21818J3KMS6 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21818J3KMS6 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21818J3KMS6 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21818J3KMS6 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21818J3KMS6 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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Gm21818J3KMS6 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21818J3KMS6 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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Gm21818J3KMS6 Nf1-202ENSMUST00000108251 9217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21818J3KMS6 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21818J3KMS6 Robo1-201ENSMUST00000023600 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21818J3KMS6 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21818J3KMS6 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21818J3KMS6 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21818J3KMS6 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21818J3KMS6 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21818J3KMS6 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21818J3KMS6 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21818J3KMS6 C4a-207ENSMUST00000160679 5371 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21818J3KMS6 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Gm21818J3KMS6 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21818J3KMS6 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21818J3KMS6 Amotl1-201ENSMUST00000013220 8957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21818J3KMS6 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm21818J3KMS6 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm21818J3KMS6 Chic1-201ENSMUST00000116547 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm21818J3KMS6 Cln8-201ENSMUST00000027554 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm21818J3KMS6 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm21818J3KMS6 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm21818J3KMS6 Thbs2-201ENSMUST00000170872 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm21818J3KMS6 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm21818J3KMS6 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm21818J3KMS6 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm21818J3KMS6 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm21818J3KMS6 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm21818J3KMS6 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm21818J3KMS6 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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