Protein–RNA interactions for Protein: F8VQC1

Srp72, Signal recognition particle subunit SRP72, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp72F8VQC1 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Srp72F8VQC1 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Srp72F8VQC1 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Srp72F8VQC1 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Srp72F8VQC1 Psd4-201ENSMUST00000056641 4748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Srp72F8VQC1 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Srp72F8VQC1 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Srp72F8VQC1 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Srp72F8VQC1 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Srp72F8VQC1 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Srp72F8VQC1 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Srp72F8VQC1 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Srp72F8VQC1 Fbxo40-201ENSMUST00000075869 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Srp72F8VQC1 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Srp72F8VQC1 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Srp72F8VQC1 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Srp72F8VQC1 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Srp72F8VQC1 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Srp72F8VQC1 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Srp72F8VQC1 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Srp72F8VQC1 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Srp72F8VQC1 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Srp72F8VQC1 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Srp72F8VQC1 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Srp72F8VQC1 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Srp72F8VQC1 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Srp72F8VQC1 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Srp72F8VQC1 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Srp72F8VQC1 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Srp72F8VQC1 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Srp72F8VQC1 Zfp68-203ENSMUST00000110905 4749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Srp72F8VQC1 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Srp72F8VQC1 Trak1-201ENSMUST00000045903 4827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Srp72F8VQC1 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Srp72F8VQC1 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Srp72F8VQC1 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Srp72F8VQC1 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Srp72F8VQC1 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Srp72F8VQC1 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Srp72F8VQC1 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Srp72F8VQC1 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Srp72F8VQC1 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Srp72F8VQC1 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Srp72F8VQC1 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Srp72F8VQC1 Arhgef4-204ENSMUST00000159747 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Srp72F8VQC1 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Srp72F8VQC1 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Srp72F8VQC1 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Srp72F8VQC1 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Srp72F8VQC1 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Srp72F8VQC1 Enpp4-201ENSMUST00000024757 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Srp72F8VQC1 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Srp72F8VQC1 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Srp72F8VQC1 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Srp72F8VQC1 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Srp72F8VQC1 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Srp72F8VQC1 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Srp72F8VQC1 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Srp72F8VQC1 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Srp72F8VQC1 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Srp72F8VQC1 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Srp72F8VQC1 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Srp72F8VQC1 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Srp72F8VQC1 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Srp72F8VQC1 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Srp72F8VQC1 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Srp72F8VQC1 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Srp72F8VQC1 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Srp72F8VQC1 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Srp72F8VQC1 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Srp72F8VQC1 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Srp72F8VQC1 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Srp72F8VQC1 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Srp72F8VQC1 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Srp72F8VQC1 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Srp72F8VQC1 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Srp72F8VQC1 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Srp72F8VQC1 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Srp72F8VQC1 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Srp72F8VQC1 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Srp72F8VQC1 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Srp72F8VQC1 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Srp72F8VQC1 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Srp72F8VQC1 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Srp72F8VQC1 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Srp72F8VQC1 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Srp72F8VQC1 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Srp72F8VQC1 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Srp72F8VQC1 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Srp72F8VQC1 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Srp72F8VQC1 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Srp72F8VQC1 3425401B19Rik-201ENSMUST00000096038 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Srp72F8VQC1 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Srp72F8VQC1 Tubgcp6-201ENSMUST00000041656 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Srp72F8VQC1 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Srp72F8VQC1 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Srp72F8VQC1 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Srp72F8VQC1 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Srp72F8VQC1 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Srp72F8VQC1 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.5 ms