Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB3

Ccdc175, Coiled-coil domain-containing protein 175, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc175E9PVB3 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Olfr311-201ENSMUST00000071625 927 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Manea-201ENSMUST00000041374 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Zmym3-209ENSMUST00000121520 5564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Dhx34-201ENSMUST00000094816 4073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Cln8-201ENSMUST00000027554 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Nfx1-203ENSMUST00000098143 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Spata31d1a-203ENSMUST00000224982 5325 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Slco2a1-201ENSMUST00000035148 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Ptpn23-201ENSMUST00000040021 5346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Dock6-207ENSMUST00000217336 6880 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Map3k12-208ENSMUST00000171565 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Gm5441-201ENSMUST00000186454 5181 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Ror2-202ENSMUST00000130235 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Gm42141-201ENSMUST00000196534 2172 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Alx1-203ENSMUST00000167156 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Col6a3-202ENSMUST00000097653 9001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Pck2-207ENSMUST00000226519 4625 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Zfp217-201ENSMUST00000063710 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Tnpo3-201ENSMUST00000012679 4251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Adcy6-201ENSMUST00000096224 6038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Tbc1d14-202ENSMUST00000124036 2765 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccdc175E9PVB3 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms