Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK1

Samd1, Atherin, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd1D3YXK1 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Samd1D3YXK1 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Samd1D3YXK1 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Samd1D3YXK1 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Samd1D3YXK1 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Samd1D3YXK1 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Samd1D3YXK1 Scyl2-204ENSMUST00000174252 4817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Samd1D3YXK1 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Samd1D3YXK1 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Samd1D3YXK1 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Samd1D3YXK1 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Samd1D3YXK1 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Samd1D3YXK1 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Samd1D3YXK1 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Samd1D3YXK1 Anks1b-218ENSMUST00000182595 3715 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Samd1D3YXK1 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Samd1D3YXK1 Rerg-201ENSMUST00000032347 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Samd1D3YXK1 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Samd1D3YXK1 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Samd1D3YXK1 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Samd1D3YXK1 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Samd1D3YXK1 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Samd1D3YXK1 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Samd1D3YXK1 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Samd1D3YXK1 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Samd1D3YXK1 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Samd1D3YXK1 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Samd1D3YXK1 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Samd1D3YXK1 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Samd1D3YXK1 Enpp4-201ENSMUST00000024757 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Samd1D3YXK1 Cln8-201ENSMUST00000027554 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Samd1D3YXK1 Zic3-201ENSMUST00000088627 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Samd1D3YXK1 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Samd1D3YXK1 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Samd1D3YXK1 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Samd1D3YXK1 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Samd1D3YXK1 Gm36814-201ENSMUST00000197457 1755 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Samd1D3YXK1 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Samd1D3YXK1 Carns1-201ENSMUST00000167055 3968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Samd1D3YXK1 Trp53inp2-201ENSMUST00000043237 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Samd1D3YXK1 1700001J11Rik-202ENSMUST00000190330 2463 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Samd1D3YXK1 Ror2-202ENSMUST00000130235 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Samd1D3YXK1 Nfic-201ENSMUST00000020461 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Samd1D3YXK1 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Samd1D3YXK1 Gtf2ird1-204ENSMUST00000100652 3693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Samd1D3YXK1 Ncdn-201ENSMUST00000030637 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Samd1D3YXK1 Myh13-203ENSMUST00000180845 5991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Samd1D3YXK1 Fmnl1-207ENSMUST00000218163 3824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Samd1D3YXK1 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Samd1D3YXK1 Olfr463-202ENSMUST00000215150 2031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Samd1D3YXK1 Parvg-207ENSMUST00000163667 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Samd1D3YXK1 Gm28581-201ENSMUST00000186086 2177 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Samd1D3YXK1 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Samd1D3YXK1 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Samd1D3YXK1 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Samd1D3YXK1 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Samd1D3YXK1 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Samd1D3YXK1 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Samd1D3YXK1 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Samd1D3YXK1 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Samd1D3YXK1 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Samd1D3YXK1 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Samd1D3YXK1 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Samd1D3YXK1 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Samd1D3YXK1 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Samd1D3YXK1 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Samd1D3YXK1 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Samd1D3YXK1 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Samd1D3YXK1 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Samd1D3YXK1 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Samd1D3YXK1 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Samd1D3YXK1 Itgb2-201ENSMUST00000000299 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Samd1D3YXK1 Crot-201ENSMUST00000003720 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Samd1D3YXK1 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Samd1D3YXK1 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Samd1D3YXK1 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Samd1D3YXK1 Prkd2-201ENSMUST00000086104 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Samd1D3YXK1 Psd-201ENSMUST00000041391 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Samd1D3YXK1 Psd-202ENSMUST00000096029 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Samd1D3YXK1 Smchd1-201ENSMUST00000127430 7052 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Samd1D3YXK1 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Samd1D3YXK1 Adra2b-202ENSMUST00000104934 4014 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Samd1D3YXK1 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Samd1D3YXK1 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Samd1D3YXK1 Spesp1-201ENSMUST00000056949 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Samd1D3YXK1 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Samd1D3YXK1 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Samd1D3YXK1 Tacc2-205ENSMUST00000207282 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Samd1D3YXK1 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Samd1D3YXK1 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Samd1D3YXK1 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Samd1D3YXK1 Rdh11-201ENSMUST00000085254 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Samd1D3YXK1 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Samd1D3YXK1 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Samd1D3YXK1 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Samd1D3YXK1 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Samd1D3YXK1 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Samd1D3YXK1 Gm45165-201ENSMUST00000207763 1631 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Samd1D3YXK1 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Samd1D3YXK1 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms