Protein–RNA interactions for Protein: B2RU40

Prrt4, Proline-rich transmembrane protein 4, mousemouse

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Length 902 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt4B2RU40 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Prrt4B2RU40 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Prrt4B2RU40 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Prrt4B2RU40 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Prrt4B2RU40 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Prrt4B2RU40 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Prrt4B2RU40 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Prrt4B2RU40 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Prrt4B2RU40 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Prrt4B2RU40 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Prrt4B2RU40 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Prrt4B2RU40 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Prrt4B2RU40 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Prrt4B2RU40 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Prrt4B2RU40 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Prrt4B2RU40 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Prrt4B2RU40 Cuzd1-201ENSMUST00000046611 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Prrt4B2RU40 Hoxa1-201ENSMUST00000000964 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Prrt4B2RU40 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Prrt4B2RU40 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Prrt4B2RU40 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Prrt4B2RU40 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Prrt4B2RU40 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Prrt4B2RU40 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Prrt4B2RU40 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Prrt4B2RU40 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Prrt4B2RU40 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Prrt4B2RU40 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Prrt4B2RU40 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Prrt4B2RU40 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Prrt4B2RU40 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC11.4□□□□□ -0.59
Prrt4B2RU40 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Prrt4B2RU40 CK137956-201ENSMUST00000030614 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Prrt4B2RU40 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Prrt4B2RU40 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Prrt4B2RU40 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Prrt4B2RU40 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Prrt4B2RU40 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Prrt4B2RU40 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Prrt4B2RU40 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Prrt4B2RU40 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Prrt4B2RU40 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Prrt4B2RU40 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Prrt4B2RU40 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Prrt4B2RU40 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Prrt4B2RU40 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Prrt4B2RU40 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Prrt4B2RU40 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Prrt4B2RU40 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Prrt4B2RU40 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Prrt4B2RU40 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Prrt4B2RU40 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Prrt4B2RU40 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Prrt4B2RU40 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Prrt4B2RU40 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Prrt4B2RU40 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Prrt4B2RU40 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Prrt4B2RU40 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Prrt4B2RU40 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Prrt4B2RU40 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Prrt4B2RU40 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Prrt4B2RU40 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Prrt4B2RU40 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Prrt4B2RU40 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Prrt4B2RU40 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Prrt4B2RU40 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Prrt4B2RU40 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Prrt4B2RU40 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Prrt4B2RU40 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Prrt4B2RU40 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Prrt4B2RU40 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Prrt4B2RU40 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Prrt4B2RU40 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Prrt4B2RU40 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Prrt4B2RU40 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Prrt4B2RU40 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Prrt4B2RU40 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Prrt4B2RU40 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Prrt4B2RU40 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Prrt4B2RU40 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Prrt4B2RU40 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Prrt4B2RU40 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Prrt4B2RU40 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Prrt4B2RU40 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Prrt4B2RU40 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Prrt4B2RU40 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Prrt4B2RU40 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Prrt4B2RU40 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Prrt4B2RU40 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Prrt4B2RU40 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Prrt4B2RU40 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Prrt4B2RU40 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Prrt4B2RU40 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Prrt4B2RU40 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Prrt4B2RU40 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Prrt4B2RU40 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Prrt4B2RU40 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Prrt4B2RU40 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Prrt4B2RU40 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Prrt4B2RU40 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms