Protein–RNA interactions for Protein: A4Q9F4

Ttll11, Tubulin polyglutamylase TTLL11, mousemouse

Predictions only

Length 727 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll11A4Q9F4 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ttll11A4Q9F4 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ttll11A4Q9F4 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ttll11A4Q9F4 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ttll11A4Q9F4 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ttll11A4Q9F4 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ttll11A4Q9F4 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ttll11A4Q9F4 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ttll11A4Q9F4 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ttll11A4Q9F4 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ttll11A4Q9F4 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ttll11A4Q9F4 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ttll11A4Q9F4 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ttll11A4Q9F4 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ttll11A4Q9F4 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ttll11A4Q9F4 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ttll11A4Q9F4 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ttll11A4Q9F4 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ttll11A4Q9F4 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ttll11A4Q9F4 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Ttll11A4Q9F4 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ttll11A4Q9F4 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ttll11A4Q9F4 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ttll11A4Q9F4 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ttll11A4Q9F4 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ttll11A4Q9F4 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Ttll11A4Q9F4 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ttll11A4Q9F4 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ttll11A4Q9F4 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ttll11A4Q9F4 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ttll11A4Q9F4 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ttll11A4Q9F4 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ttll11A4Q9F4 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ttll11A4Q9F4 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ttll11A4Q9F4 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ttll11A4Q9F4 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ttll11A4Q9F4 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ttll11A4Q9F4 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Ttll11A4Q9F4 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ttll11A4Q9F4 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Ttll11A4Q9F4 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ttll11A4Q9F4 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ttll11A4Q9F4 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Ttll11A4Q9F4 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ttll11A4Q9F4 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Ttll11A4Q9F4 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ttll11A4Q9F4 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ttll11A4Q9F4 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ttll11A4Q9F4 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ttll11A4Q9F4 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ttll11A4Q9F4 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Ttll11A4Q9F4 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ttll11A4Q9F4 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ttll11A4Q9F4 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ttll11A4Q9F4 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ttll11A4Q9F4 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ttll11A4Q9F4 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ttll11A4Q9F4 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ttll11A4Q9F4 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ttll11A4Q9F4 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ttll11A4Q9F4 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ttll11A4Q9F4 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Ttll11A4Q9F4 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Ttll11A4Q9F4 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ttll11A4Q9F4 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ttll11A4Q9F4 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ttll11A4Q9F4 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ttll11A4Q9F4 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ttll11A4Q9F4 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ttll11A4Q9F4 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ttll11A4Q9F4 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ttll11A4Q9F4 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ttll11A4Q9F4 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ttll11A4Q9F4 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ttll11A4Q9F4 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ttll11A4Q9F4 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Ttll11A4Q9F4 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Ttll11A4Q9F4 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ttll11A4Q9F4 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Ttll11A4Q9F4 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ttll11A4Q9F4 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ttll11A4Q9F4 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ttll11A4Q9F4 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ttll11A4Q9F4 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ttll11A4Q9F4 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ttll11A4Q9F4 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ttll11A4Q9F4 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ttll11A4Q9F4 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ttll11A4Q9F4 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ttll11A4Q9F4 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ttll11A4Q9F4 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ttll11A4Q9F4 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ttll11A4Q9F4 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ttll11A4Q9F4 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ttll11A4Q9F4 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ttll11A4Q9F4 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ttll11A4Q9F4 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ttll11A4Q9F4 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ttll11A4Q9F4 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ttll11A4Q9F4 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms