Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP6

Gm5538, MCG67716, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5538W4VSP6 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm5538W4VSP6 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm5538W4VSP6 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm5538W4VSP6 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm5538W4VSP6 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm5538W4VSP6 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm5538W4VSP6 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm5538W4VSP6 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm5538W4VSP6 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm5538W4VSP6 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm5538W4VSP6 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm5538W4VSP6 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm5538W4VSP6 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm5538W4VSP6 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm5538W4VSP6 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm5538W4VSP6 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm5538W4VSP6 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm5538W4VSP6 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm5538W4VSP6 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm5538W4VSP6 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm5538W4VSP6 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm5538W4VSP6 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm5538W4VSP6 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm5538W4VSP6 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm5538W4VSP6 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm5538W4VSP6 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm5538W4VSP6 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm5538W4VSP6 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm5538W4VSP6 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm5538W4VSP6 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm5538W4VSP6 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm5538W4VSP6 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm5538W4VSP6 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm5538W4VSP6 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm5538W4VSP6 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm5538W4VSP6 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm5538W4VSP6 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm5538W4VSP6 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm5538W4VSP6 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm5538W4VSP6 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm5538W4VSP6 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm5538W4VSP6 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
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Gm5538W4VSP6 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm5538W4VSP6 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm5538W4VSP6 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm5538W4VSP6 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm5538W4VSP6 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm5538W4VSP6 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm5538W4VSP6 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm5538W4VSP6 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm5538W4VSP6 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm5538W4VSP6 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm5538W4VSP6 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm5538W4VSP6 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm5538W4VSP6 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm5538W4VSP6 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm5538W4VSP6 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm5538W4VSP6 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm5538W4VSP6 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm5538W4VSP6 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm5538W4VSP6 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm5538W4VSP6 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm5538W4VSP6 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm5538W4VSP6 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm5538W4VSP6 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm5538W4VSP6 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm5538W4VSP6 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm5538W4VSP6 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm5538W4VSP6 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm5538W4VSP6 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm5538W4VSP6 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm5538W4VSP6 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm5538W4VSP6 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm5538W4VSP6 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm5538W4VSP6 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm5538W4VSP6 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm5538W4VSP6 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm5538W4VSP6 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm5538W4VSP6 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm5538W4VSP6 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm5538W4VSP6 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm5538W4VSP6 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm5538W4VSP6 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm5538W4VSP6 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm5538W4VSP6 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm5538W4VSP6 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm5538W4VSP6 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm5538W4VSP6 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm5538W4VSP6 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm5538W4VSP6 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm5538W4VSP6 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm5538W4VSP6 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm5538W4VSP6 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm5538W4VSP6 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm5538W4VSP6 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm5538W4VSP6 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm5538W4VSP6 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm5538W4VSP6 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm5538W4VSP6 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
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