Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN7

Gm3550, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3550W4VSN7 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Tox4-201ENSMUST00000022766 5350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC9.96□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Gm3550W4VSN7 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Gm3550W4VSN7 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Gm3550W4VSN7 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Gm3550W4VSN7 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Gm3550W4VSN7 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Gm3550W4VSN7 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Gm3550W4VSN7 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Gm3550W4VSN7 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Gm3550W4VSN7 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Gm3550W4VSN7 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Gm3550W4VSN7 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Gm3550W4VSN7 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Gm3550W4VSN7 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Gm3550W4VSN7 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Gm3550W4VSN7 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Gm3550W4VSN7 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Gm3550W4VSN7 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Gm3550W4VSN7 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Gm3550W4VSN7 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Gm3550W4VSN7 Arpp21-223ENSMUST00000162097 3952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Gm3550W4VSN7 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Gm3550W4VSN7 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Gm3550W4VSN7 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Gm3550W4VSN7 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Gm3550W4VSN7 Edil3-202ENSMUST00000081769 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Gm3550W4VSN7 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Gm3550W4VSN7 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Gm3550W4VSN7 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Gm3550W4VSN7 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Gm3550W4VSN7 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Gm3550W4VSN7 Nf1-202ENSMUST00000108251 9217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Gm3550W4VSN7 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Gm3550W4VSN7 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Gm3550W4VSN7 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Gm3550W4VSN7 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Gm3550W4VSN7 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm3550W4VSN7 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm3550W4VSN7 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm3550W4VSN7 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm3550W4VSN7 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm3550W4VSN7 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm3550W4VSN7 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm3550W4VSN7 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm3550W4VSN7 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm3550W4VSN7 Ankrd52-201ENSMUST00000014642 6620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm3550W4VSN7 Col6a6-203ENSMUST00000166431 7098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm3550W4VSN7 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm3550W4VSN7 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm3550W4VSN7 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm3550W4VSN7 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm3550W4VSN7 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm3550W4VSN7 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm3550W4VSN7 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm3550W4VSN7 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm3550W4VSN7 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm3550W4VSN7 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm3550W4VSN7 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm3550W4VSN7 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.1 ms