Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2L7

Crlf3, Cytokine receptor-like factor 3, mousemouse

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Length 442 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crlf3Q9Z2L7 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Crlf3Q9Z2L7 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Crlf3Q9Z2L7 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Crlf3Q9Z2L7 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Crlf3Q9Z2L7 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Crlf3Q9Z2L7 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Crlf3Q9Z2L7 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Crlf3Q9Z2L7 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Crlf3Q9Z2L7 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Crlf3Q9Z2L7 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Crlf3Q9Z2L7 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Crlf3Q9Z2L7 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Crlf3Q9Z2L7 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Crlf3Q9Z2L7 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Crlf3Q9Z2L7 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Crlf3Q9Z2L7 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Crlf3Q9Z2L7 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Crlf3Q9Z2L7 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Crlf3Q9Z2L7 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Crlf3Q9Z2L7 Col20a1-201ENSMUST00000108856 4489 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Crlf3Q9Z2L7 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Crlf3Q9Z2L7 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Crlf3Q9Z2L7 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Crlf3Q9Z2L7 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Crlf3Q9Z2L7 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Crlf3Q9Z2L7 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Crlf3Q9Z2L7 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Crlf3Q9Z2L7 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Crlf3Q9Z2L7 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Crlf3Q9Z2L7 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Crlf3Q9Z2L7 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Crlf3Q9Z2L7 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Crlf3Q9Z2L7 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Crlf3Q9Z2L7 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Crlf3Q9Z2L7 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Crlf3Q9Z2L7 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Crlf3Q9Z2L7 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Crlf3Q9Z2L7 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Crlf3Q9Z2L7 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Crlf3Q9Z2L7 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Crlf3Q9Z2L7 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Crlf3Q9Z2L7 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Crlf3Q9Z2L7 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Crlf3Q9Z2L7 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Crlf3Q9Z2L7 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Crlf3Q9Z2L7 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Crlf3Q9Z2L7 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Crlf3Q9Z2L7 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Crlf3Q9Z2L7 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Crlf3Q9Z2L7 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Crlf3Q9Z2L7 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Crlf3Q9Z2L7 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Crlf3Q9Z2L7 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Crlf3Q9Z2L7 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Crlf3Q9Z2L7 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Crlf3Q9Z2L7 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Crlf3Q9Z2L7 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Crlf3Q9Z2L7 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Crlf3Q9Z2L7 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Crlf3Q9Z2L7 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Crlf3Q9Z2L7 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Crlf3Q9Z2L7 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Crlf3Q9Z2L7 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Crlf3Q9Z2L7 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Crlf3Q9Z2L7 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Crlf3Q9Z2L7 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Crlf3Q9Z2L7 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Crlf3Q9Z2L7 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Crlf3Q9Z2L7 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Crlf3Q9Z2L7 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Crlf3Q9Z2L7 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Crlf3Q9Z2L7 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Crlf3Q9Z2L7 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms