Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX96

Sall2, Sal-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,004 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall2Q9QX96 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sall2Q9QX96 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sall2Q9QX96 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sall2Q9QX96 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sall2Q9QX96 Psd3-213ENSMUST00000212505 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sall2Q9QX96 Ncf1-202ENSMUST00000111275 2721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sall2Q9QX96 A930016O22Rik-202ENSMUST00000208685 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sall2Q9QX96 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sall2Q9QX96 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sall2Q9QX96 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sall2Q9QX96 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sall2Q9QX96 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sall2Q9QX96 Igsf3-202ENSMUST00000195164 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sall2Q9QX96 Sp140-201ENSMUST00000080204 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sall2Q9QX96 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sall2Q9QX96 Plpp3-201ENSMUST00000064139 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sall2Q9QX96 Lrrc8a-201ENSMUST00000095078 4301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sall2Q9QX96 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sall2Q9QX96 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sall2Q9QX96 Cct3-204ENSMUST00000164166 1804 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sall2Q9QX96 Zfp354a-204ENSMUST00000109122 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sall2Q9QX96 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sall2Q9QX96 Dld-201ENSMUST00000110857 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sall2Q9QX96 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sall2Q9QX96 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Sall2Q9QX96 Id2-201ENSMUST00000020974 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sall2Q9QX96 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sall2Q9QX96 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sall2Q9QX96 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sall2Q9QX96 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sall2Q9QX96 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sall2Q9QX96 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sall2Q9QX96 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sall2Q9QX96 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sall2Q9QX96 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sall2Q9QX96 Ablim2-204ENSMUST00000114204 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sall2Q9QX96 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sall2Q9QX96 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sall2Q9QX96 Nf2-202ENSMUST00000056290 2394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sall2Q9QX96 Oas1d-201ENSMUST00000044224 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sall2Q9QX96 Dglucy-204ENSMUST00000110073 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sall2Q9QX96 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sall2Q9QX96 Tasp1-202ENSMUST00000099304 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sall2Q9QX96 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sall2Q9QX96 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sall2Q9QX96 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sall2Q9QX96 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sall2Q9QX96 AC122273.1-201ENSMUST00000213634 2327 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Sall2Q9QX96 Gpcpd1-202ENSMUST00000060955 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sall2Q9QX96 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sall2Q9QX96 Actl7a-201ENSMUST00000095079 1513 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sall2Q9QX96 Tmcc2-201ENSMUST00000045473 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sall2Q9QX96 Zfp114-203ENSMUST00000206547 3154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sall2Q9QX96 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sall2Q9QX96 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sall2Q9QX96 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sall2Q9QX96 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sall2Q9QX96 Pid1-205ENSMUST00000176720 450 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sall2Q9QX96 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sall2Q9QX96 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Sall2Q9QX96 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sall2Q9QX96 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Sall2Q9QX96 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sall2Q9QX96 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sall2Q9QX96 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sall2Q9QX96 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sall2Q9QX96 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sall2Q9QX96 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Sall2Q9QX96 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sall2Q9QX96 Mpp4-203ENSMUST00000114275 2982 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sall2Q9QX96 Ccar2-201ENSMUST00000035612 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sall2Q9QX96 Gm40617-201ENSMUST00000218840 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sall2Q9QX96 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Sall2Q9QX96 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Sall2Q9QX96 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sall2Q9QX96 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sall2Q9QX96 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sall2Q9QX96 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sall2Q9QX96 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sall2Q9QX96 Pou2f1-206ENSMUST00000111429 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sall2Q9QX96 Tcn2-207ENSMUST00000109993 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sall2Q9QX96 Usp2-203ENSMUST00000114830 2122 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sall2Q9QX96 H2-T3-201ENSMUST00000025312 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sall2Q9QX96 Fbxo8-201ENSMUST00000040218 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sall2Q9QX96 Gm35021-201ENSMUST00000210105 2329 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sall2Q9QX96 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sall2Q9QX96 Pcdhb2-201ENSMUST00000056522 2813 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sall2Q9QX96 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sall2Q9QX96 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sall2Q9QX96 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sall2Q9QX96 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Sall2Q9QX96 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sall2Q9QX96 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sall2Q9QX96 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Sall2Q9QX96 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sall2Q9QX96 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sall2Q9QX96 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sall2Q9QX96 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sall2Q9QX96 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sall2Q9QX96 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.2 ms