Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMK2

Csnk1e, Casein kinase I isoform epsilon, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1eQ9JMK2 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Csnk1eQ9JMK2 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Csnk1eQ9JMK2 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Csnk1eQ9JMK2 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Csnk1eQ9JMK2 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Csnk1eQ9JMK2 Ighv10-1-201ENSMUST00000103492 359 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Csnk1eQ9JMK2 Polr2i-203ENSMUST00000108193 488 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Csnk1eQ9JMK2 Rpl15-204ENSMUST00000112598 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Csnk1eQ9JMK2 Gm12990-201ENSMUST00000120372 468 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Csnk1eQ9JMK2 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Csnk1eQ9JMK2 Gm37826-201ENSMUST00000195329 322 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Csnk1eQ9JMK2 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Csnk1eQ9JMK2 Gm4744-201ENSMUST00000073642 792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Csnk1eQ9JMK2 Olfr1047-201ENSMUST00000099901 960 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Csnk1eQ9JMK2 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Csnk1eQ9JMK2 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Csnk1eQ9JMK2 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Csnk1eQ9JMK2 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Csnk1eQ9JMK2 Anxa9-204ENSMUST00000164406 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Csnk1eQ9JMK2 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Csnk1eQ9JMK2 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Csnk1eQ9JMK2 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Csnk1eQ9JMK2 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Csnk1eQ9JMK2 Cipc-208ENSMUST00000189246 1454 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Csnk1eQ9JMK2 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Csnk1eQ9JMK2 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Csnk1eQ9JMK2 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Csnk1eQ9JMK2 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Csnk1eQ9JMK2 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Csnk1eQ9JMK2 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Csnk1eQ9JMK2 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Csnk1eQ9JMK2 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Csnk1eQ9JMK2 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Csnk1eQ9JMK2 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Csnk1eQ9JMK2 Nudt6-203ENSMUST00000108117 879 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Csnk1eQ9JMK2 Gm12969-201ENSMUST00000120199 1004 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Csnk1eQ9JMK2 Cntrobos-201ENSMUST00000132834 383 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Csnk1eQ9JMK2 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Csnk1eQ9JMK2 Mfsd11-212ENSMUST00000153084 1194 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Csnk1eQ9JMK2 Gm26134-201ENSMUST00000178484 110 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Csnk1eQ9JMK2 Gm17889-201ENSMUST00000198410 598 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Csnk1eQ9JMK2 D5Ertd615e-203ENSMUST00000198493 1032 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Csnk1eQ9JMK2 Gm44759-201ENSMUST00000206057 430 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Csnk1eQ9JMK2 Gm18059-201ENSMUST00000208073 580 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Csnk1eQ9JMK2 Gm45410-201ENSMUST00000211331 1093 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Csnk1eQ9JMK2 CT030653.1-201ENSMUST00000224382 1279 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Csnk1eQ9JMK2 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Csnk1eQ9JMK2 Sssca1-201ENSMUST00000025885 693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Csnk1eQ9JMK2 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Csnk1eQ9JMK2 Gbgt1-201ENSMUST00000028172 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Csnk1eQ9JMK2 Chmp3-202ENSMUST00000065364 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Csnk1eQ9JMK2 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Csnk1eQ9JMK2 Gm5544-201ENSMUST00000098828 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Csnk1eQ9JMK2 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Csnk1eQ9JMK2 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Csnk1eQ9JMK2 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Csnk1eQ9JMK2 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Csnk1eQ9JMK2 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Csnk1eQ9JMK2 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Csnk1eQ9JMK2 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Csnk1eQ9JMK2 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Csnk1eQ9JMK2 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Csnk1eQ9JMK2 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Csnk1eQ9JMK2 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Csnk1eQ9JMK2 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Csnk1eQ9JMK2 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Csnk1eQ9JMK2 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Csnk1eQ9JMK2 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Csnk1eQ9JMK2 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Csnk1eQ9JMK2 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Csnk1eQ9JMK2 Gm21358-201ENSMUST00000191645 1659 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Csnk1eQ9JMK2 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Csnk1eQ9JMK2 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Csnk1eQ9JMK2 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Csnk1eQ9JMK2 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Csnk1eQ9JMK2 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Csnk1eQ9JMK2 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Csnk1eQ9JMK2 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Csnk1eQ9JMK2 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Csnk1eQ9JMK2 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Csnk1eQ9JMK2 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Csnk1eQ9JMK2 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Csnk1eQ9JMK2 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Csnk1eQ9JMK2 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Csnk1eQ9JMK2 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Csnk1eQ9JMK2 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Csnk1eQ9JMK2 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Csnk1eQ9JMK2 Gm11422-201ENSMUST00000118925 1103 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Csnk1eQ9JMK2 Gm12030-201ENSMUST00000121917 223 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Csnk1eQ9JMK2 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Csnk1eQ9JMK2 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Csnk1eQ9JMK2 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Csnk1eQ9JMK2 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Csnk1eQ9JMK2 Gm29040-201ENSMUST00000189899 1188 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Csnk1eQ9JMK2 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Csnk1eQ9JMK2 Gm37419-201ENSMUST00000210705 114 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Csnk1eQ9JMK2 Gm45758-201ENSMUST00000212448 1006 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Csnk1eQ9JMK2 Ap3s1-202ENSMUST00000224622 978 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Csnk1eQ9JMK2 Ly6i-201ENSMUST00000023250 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Csnk1eQ9JMK2 Nudt2-201ENSMUST00000030154 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
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