Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Col5a3Q9JLI2 Kdelc1-201ENSMUST00000027213 1765 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Col5a3Q9JLI2 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Col5a3Q9JLI2 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Col5a3Q9JLI2 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Col5a3Q9JLI2 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Col5a3Q9JLI2 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Col5a3Q9JLI2 Tex13c1-201ENSMUST00000105113 2074 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Col5a3Q9JLI2 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Col5a3Q9JLI2 Cops3-201ENSMUST00000019517 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Col5a3Q9JLI2 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Col5a3Q9JLI2 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Col5a3Q9JLI2 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Col5a3Q9JLI2 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Col5a3Q9JLI2 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Col5a3Q9JLI2 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Col5a3Q9JLI2 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Col5a3Q9JLI2 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Col5a3Q9JLI2 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Col5a3Q9JLI2 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Col5a3Q9JLI2 Pfn1-202ENSMUST00000108549 608 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Col5a3Q9JLI2 Bnip2-208ENSMUST00000165389 945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Col5a3Q9JLI2 Snord55-201ENSMUST00000174939 79 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Col5a3Q9JLI2 Gm42751-201ENSMUST00000198065 559 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Col5a3Q9JLI2 Gpx4-ps2-201ENSMUST00000214811 555 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Col5a3Q9JLI2 AC105408.1-201ENSMUST00000227771 802 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Col5a3Q9JLI2 Psca-201ENSMUST00000023265 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Col5a3Q9JLI2 Tspan8-202ENSMUST00000080630 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Col5a3Q9JLI2 Gm38192-201ENSMUST00000194364 1847 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Col5a3Q9JLI2 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Col5a3Q9JLI2 Pabpc1l-201ENSMUST00000067715 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Col5a3Q9JLI2 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Col5a3Q9JLI2 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Col5a3Q9JLI2 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Col5a3Q9JLI2 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Col5a3Q9JLI2 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Col5a3Q9JLI2 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Col5a3Q9JLI2 Gm37160-201ENSMUST00000193081 1689 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Col5a3Q9JLI2 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Col5a3Q9JLI2 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Col5a3Q9JLI2 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Col5a3Q9JLI2 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Col5a3Q9JLI2 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Col5a3Q9JLI2 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Col5a3Q9JLI2 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Col5a3Q9JLI2 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Col5a3Q9JLI2 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Col5a3Q9JLI2 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Col5a3Q9JLI2 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Col5a3Q9JLI2 Trbv31-201ENSMUST00000103300 334 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Col5a3Q9JLI2 D3Ertd751e-204ENSMUST00000119572 1011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Col5a3Q9JLI2 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Col5a3Q9JLI2 Gm26906-201ENSMUST00000180523 1228 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Col5a3Q9JLI2 Gm8601-201ENSMUST00000182096 909 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
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Col5a3Q9JLI2 Adh6-ps1-202ENSMUST00000196293 754 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Col5a3Q9JLI2 Gm6352-201ENSMUST00000203583 1134 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Col5a3Q9JLI2 4933407L21Rik-201ENSMUST00000027426 1146 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Col5a3Q9JLI2 Ngp-201ENSMUST00000035061 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Col5a3Q9JLI2 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Col5a3Q9JLI2 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Col5a3Q9JLI2 Gm7168-201ENSMUST00000088809 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Col5a3Q9JLI2 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Col5a3Q9JLI2 Ido1-202ENSMUST00000110667 1656 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Col5a3Q9JLI2 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Col5a3Q9JLI2 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Col5a3Q9JLI2 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Col5a3Q9JLI2 Gm15965-201ENSMUST00000123318 1428 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Col5a3Q9JLI2 Tubb1-201ENSMUST00000016399 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Col5a3Q9JLI2 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Col5a3Q9JLI2 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Col5a3Q9JLI2 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Col5a3Q9JLI2 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Col5a3Q9JLI2 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Col5a3Q9JLI2 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Col5a3Q9JLI2 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Col5a3Q9JLI2 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Col5a3Q9JLI2 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Col5a3Q9JLI2 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Col5a3Q9JLI2 Gm23255-201ENSMUST00000102244 110 ntBASIC12.08□□□□□ -0.47
Col5a3Q9JLI2 Gm12986-201ENSMUST00000119037 967 ntBASIC12.08□□□□□ -0.47
Col5a3Q9JLI2 Gm16538-201ENSMUST00000162407 442 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.47
Col5a3Q9JLI2 Gm27003-201ENSMUST00000182590 497 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.47
Col5a3Q9JLI2 Sbsn-205ENSMUST00000182721 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.47
Col5a3Q9JLI2 Gm44498-201ENSMUST00000199509 111 ntBASIC12.08□□□□□ -0.47
Col5a3Q9JLI2 Gm7939-201ENSMUST00000201233 1050 ntBASIC12.08□□□□□ -0.47
Col5a3Q9JLI2 BC080696-201ENSMUST00000202858 1218 ntBASIC12.08□□□□□ -0.47
Col5a3Q9JLI2 Ywhaq-ps1-201ENSMUST00000206623 710 ntBASIC12.08□□□□□ -0.47
Col5a3Q9JLI2 Lsm3-201ENSMUST00000040607 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Col5a3Q9JLI2 Defb29-201ENSMUST00000060598 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Col5a3Q9JLI2 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Col5a3Q9JLI2 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Col5a3Q9JLI2 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Col5a3Q9JLI2 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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