Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK97

Kcnq4, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 4, mousemouse

Predictions only

Length 696 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnq4Q9JK97 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Kcnq4Q9JK97 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Kcnq4Q9JK97 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Kcnq4Q9JK97 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Kcnq4Q9JK97 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Kcnq4Q9JK97 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Kcnq4Q9JK97 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Kcnq4Q9JK97 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Kcnq4Q9JK97 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Kcnq4Q9JK97 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Kcnq4Q9JK97 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Kcnq4Q9JK97 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Kcnq4Q9JK97 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Kcnq4Q9JK97 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Kcnq4Q9JK97 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Kcnq4Q9JK97 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Kcnq4Q9JK97 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Kcnq4Q9JK97 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Kcnq4Q9JK97 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Kcnq4Q9JK97 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Kcnq4Q9JK97 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Kcnq4Q9JK97 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Kcnq4Q9JK97 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Kcnq4Q9JK97 Adap2os-201ENSMUST00000140556 984 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Kcnq4Q9JK97 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Kcnq4Q9JK97 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Kcnq4Q9JK97 Mir1956-201ENSMUST00000157748 65 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Kcnq4Q9JK97 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Kcnq4Q9JK97 Gm37028-201ENSMUST00000194276 107 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Kcnq4Q9JK97 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Kcnq4Q9JK97 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Kcnq4Q9JK97 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Kcnq4Q9JK97 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Kcnq4Q9JK97 Gm40709-203ENSMUST00000219695 973 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Kcnq4Q9JK97 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Kcnq4Q9JK97 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Kcnq4Q9JK97 Mirlet7i-201ENSMUST00000083472 85 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Kcnq4Q9JK97 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Kcnq4Q9JK97 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Kcnq4Q9JK97 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Kcnq4Q9JK97 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Kcnq4Q9JK97 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Kcnq4Q9JK97 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Kcnq4Q9JK97 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Kcnq4Q9JK97 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Kcnq4Q9JK97 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Kcnq4Q9JK97 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Kcnq4Q9JK97 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Kcnq4Q9JK97 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Kcnq4Q9JK97 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Kcnq4Q9JK97 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Kcnq4Q9JK97 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Kcnq4Q9JK97 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Kcnq4Q9JK97 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Kcnq4Q9JK97 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Kcnq4Q9JK97 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Kcnq4Q9JK97 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Kcnq4Q9JK97 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Kcnq4Q9JK97 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Kcnq4Q9JK97 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Kcnq4Q9JK97 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Kcnq4Q9JK97 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Kcnq4Q9JK97 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Kcnq4Q9JK97 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Kcnq4Q9JK97 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Kcnq4Q9JK97 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Kcnq4Q9JK97 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Kcnq4Q9JK97 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Kcnq4Q9JK97 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Kcnq4Q9JK97 Gm12106-201ENSMUST00000116006 1200 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Kcnq4Q9JK97 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Kcnq4Q9JK97 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Kcnq4Q9JK97 Nop56-204ENSMUST00000136621 868 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Kcnq4Q9JK97 1700122E12Rik-202ENSMUST00000147538 479 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Kcnq4Q9JK97 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Kcnq4Q9JK97 9930004E17Rik-201ENSMUST00000180031 498 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Kcnq4Q9JK97 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Kcnq4Q9JK97 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Kcnq4Q9JK97 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Kcnq4Q9JK97 AC174797.2-202ENSMUST00000225729 568 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Kcnq4Q9JK97 AC102368.1-201ENSMUST00000227161 892 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Kcnq4Q9JK97 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Kcnq4Q9JK97 Cmtm2a-201ENSMUST00000034344 1081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Kcnq4Q9JK97 Gm9873-201ENSMUST00000063891 1097 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Kcnq4Q9JK97 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Kcnq4Q9JK97 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Kcnq4Q9JK97 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Kcnq4Q9JK97 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Kcnq4Q9JK97 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Kcnq4Q9JK97 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Kcnq4Q9JK97 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Kcnq4Q9JK97 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Kcnq4Q9JK97 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Kcnq4Q9JK97 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Kcnq4Q9JK97 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Kcnq4Q9JK97 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Kcnq4Q9JK97 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Kcnq4Q9JK97 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Kcnq4Q9JK97 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Kcnq4Q9JK97 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms