Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC28

Csnk1d, Casein kinase I isoform delta, mousemouse

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1dQ9DC28 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Csnk1dQ9DC28 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Csnk1dQ9DC28 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Csnk1dQ9DC28 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Csnk1dQ9DC28 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Csnk1dQ9DC28 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Csnk1dQ9DC28 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
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