Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J1

Efhd1, EF-hand domain-containing protein D1, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efhd1Q9D4J1 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Efhd1Q9D4J1 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Efhd1Q9D4J1 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Efhd1Q9D4J1 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Efhd1Q9D4J1 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Efhd1Q9D4J1 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Efhd1Q9D4J1 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Efhd1Q9D4J1 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Efhd1Q9D4J1 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Efhd1Q9D4J1 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Efhd1Q9D4J1 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Efhd1Q9D4J1 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Efhd1Q9D4J1 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Efhd1Q9D4J1 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Efhd1Q9D4J1 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Efhd1Q9D4J1 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Efhd1Q9D4J1 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Efhd1Q9D4J1 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Efhd1Q9D4J1 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Efhd1Q9D4J1 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Efhd1Q9D4J1 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Efhd1Q9D4J1 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Efhd1Q9D4J1 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Efhd1Q9D4J1 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Efhd1Q9D4J1 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Efhd1Q9D4J1 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Efhd1Q9D4J1 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Efhd1Q9D4J1 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Efhd1Q9D4J1 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Efhd1Q9D4J1 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Efhd1Q9D4J1 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Efhd1Q9D4J1 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Efhd1Q9D4J1 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Efhd1Q9D4J1 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Efhd1Q9D4J1 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Efhd1Q9D4J1 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Efhd1Q9D4J1 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Efhd1Q9D4J1 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Efhd1Q9D4J1 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Efhd1Q9D4J1 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Efhd1Q9D4J1 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Efhd1Q9D4J1 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Efhd1Q9D4J1 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Efhd1Q9D4J1 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Efhd1Q9D4J1 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Efhd1Q9D4J1 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Efhd1Q9D4J1 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Efhd1Q9D4J1 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Efhd1Q9D4J1 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Efhd1Q9D4J1 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Efhd1Q9D4J1 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Efhd1Q9D4J1 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Efhd1Q9D4J1 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Efhd1Q9D4J1 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Efhd1Q9D4J1 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Efhd1Q9D4J1 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Efhd1Q9D4J1 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Efhd1Q9D4J1 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Efhd1Q9D4J1 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Efhd1Q9D4J1 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Efhd1Q9D4J1 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Efhd1Q9D4J1 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Efhd1Q9D4J1 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Efhd1Q9D4J1 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Efhd1Q9D4J1 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Efhd1Q9D4J1 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Efhd1Q9D4J1 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Efhd1Q9D4J1 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Efhd1Q9D4J1 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Efhd1Q9D4J1 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Efhd1Q9D4J1 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Efhd1Q9D4J1 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Efhd1Q9D4J1 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Efhd1Q9D4J1 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Efhd1Q9D4J1 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Efhd1Q9D4J1 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Efhd1Q9D4J1 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Efhd1Q9D4J1 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Efhd1Q9D4J1 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Efhd1Q9D4J1 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Efhd1Q9D4J1 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Efhd1Q9D4J1 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Efhd1Q9D4J1 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Efhd1Q9D4J1 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Efhd1Q9D4J1 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Efhd1Q9D4J1 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Efhd1Q9D4J1 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Efhd1Q9D4J1 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Efhd1Q9D4J1 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Efhd1Q9D4J1 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Efhd1Q9D4J1 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Efhd1Q9D4J1 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Efhd1Q9D4J1 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Efhd1Q9D4J1 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Efhd1Q9D4J1 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Efhd1Q9D4J1 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Efhd1Q9D4J1 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Efhd1Q9D4J1 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Efhd1Q9D4J1 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Efhd1Q9D4J1 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms