Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWM4

Pfdn1, Prefoldin subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn1Q9CWM4 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 Alas1-202ENSMUST00000112524 3089 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 Themis2-201ENSMUST00000045154 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 Drc7-201ENSMUST00000058479 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 Fam13c-201ENSMUST00000062883 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 Copb1-201ENSMUST00000033012 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 Kcne2-201ENSMUST00000047383 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 Lama5-201ENSMUST00000015791 11388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 Nlrp6-201ENSMUST00000106045 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 Ccdc129-201ENSMUST00000044729 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 AC158779.1-201ENSMUST00000228912 3861 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 Fastkd5-201ENSMUST00000110262 3015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 Csgalnact1-201ENSMUST00000078350 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 Skiv2l-201ENSMUST00000046022 3951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 4833418N02Rik-201ENSMUST00000137539 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 Pcdhga1-201ENSMUST00000194190 4692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 Slfn1-201ENSMUST00000037994 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 Cdca2-207ENSMUST00000163100 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 Gm16169-202ENSMUST00000162432 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 Gm33914-201ENSMUST00000214108 2150 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 Kcnip3-203ENSMUST00000103215 2732 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 Kcnip3-201ENSMUST00000028850 2728 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 Sema4d-201ENSMUST00000021900 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 Pcdh15-231ENSMUST00000177107 5696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 Unkl-201ENSMUST00000015271 3414 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 Gtf3c2-201ENSMUST00000088010 4552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 Oas1h-201ENSMUST00000072476 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 Agbl5-201ENSMUST00000069705 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 AC165148.1-201ENSMUST00000224795 2372 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 Megf11-202ENSMUST00000093829 3652 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 Rgs8-202ENSMUST00000111810 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 Fbxo32-201ENSMUST00000022986 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 Slc45a3-202ENSMUST00000177943 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 Calu-201ENSMUST00000031779 3229 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 Gm43086-201ENSMUST00000202536 2657 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 Sbf2-205ENSMUST00000164759 7090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 Col6a5-201ENSMUST00000165165 8046 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 Cacna1c-206ENSMUST00000185345 6579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 Mgll-204ENSMUST00000113585 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 Trem1-201ENSMUST00000048782 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 Pcdhgc5-201ENSMUST00000055935 4741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 Cdkl5-205ENSMUST00000198931 9796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 Atxn1l-202ENSMUST00000212605 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 Vipas39-202ENSMUST00000072744 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 Fam227a-203ENSMUST00000109648 5187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms