Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ56

Use1, Vesicle transport protein USE1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Use1Q9CQ56 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Use1Q9CQ56 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Use1Q9CQ56 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Use1Q9CQ56 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Use1Q9CQ56 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
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Use1Q9CQ56 Edil3-202ENSMUST00000081769 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Use1Q9CQ56 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Use1Q9CQ56 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Use1Q9CQ56 Dclk2-202ENSMUST00000191752 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Use1Q9CQ56 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Use1Q9CQ56 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Use1Q9CQ56 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
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