Protein–RNA interactions for Protein: Q99PN3

Trim26, Tripartite motif-containing protein 26, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim26Q99PN3 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim26Q99PN3 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim26Q99PN3 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim26Q99PN3 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim26Q99PN3 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim26Q99PN3 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim26Q99PN3 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim26Q99PN3 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim26Q99PN3 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim26Q99PN3 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim26Q99PN3 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim26Q99PN3 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim26Q99PN3 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim26Q99PN3 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim26Q99PN3 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim26Q99PN3 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim26Q99PN3 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim26Q99PN3 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim26Q99PN3 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim26Q99PN3 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim26Q99PN3 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim26Q99PN3 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim26Q99PN3 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim26Q99PN3 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim26Q99PN3 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim26Q99PN3 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim26Q99PN3 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim26Q99PN3 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trim26Q99PN3 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trim26Q99PN3 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trim26Q99PN3 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trim26Q99PN3 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trim26Q99PN3 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trim26Q99PN3 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trim26Q99PN3 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trim26Q99PN3 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trim26Q99PN3 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trim26Q99PN3 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trim26Q99PN3 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trim26Q99PN3 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trim26Q99PN3 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Trim26Q99PN3 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trim26Q99PN3 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trim26Q99PN3 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trim26Q99PN3 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trim26Q99PN3 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trim26Q99PN3 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trim26Q99PN3 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Trim26Q99PN3 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Trim26Q99PN3 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trim26Q99PN3 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Trim26Q99PN3 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Trim26Q99PN3 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trim26Q99PN3 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Trim26Q99PN3 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trim26Q99PN3 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Trim26Q99PN3 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Trim26Q99PN3 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trim26Q99PN3 Mov10l1-203ENSMUST00000146993 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trim26Q99PN3 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trim26Q99PN3 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trim26Q99PN3 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trim26Q99PN3 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trim26Q99PN3 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Trim26Q99PN3 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trim26Q99PN3 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trim26Q99PN3 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trim26Q99PN3 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trim26Q99PN3 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trim26Q99PN3 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim26Q99PN3 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim26Q99PN3 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim26Q99PN3 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim26Q99PN3 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim26Q99PN3 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim26Q99PN3 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim26Q99PN3 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim26Q99PN3 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim26Q99PN3 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim26Q99PN3 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim26Q99PN3 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim26Q99PN3 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim26Q99PN3 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim26Q99PN3 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim26Q99PN3 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim26Q99PN3 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim26Q99PN3 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim26Q99PN3 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim26Q99PN3 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim26Q99PN3 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim26Q99PN3 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim26Q99PN3 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim26Q99PN3 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim26Q99PN3 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim26Q99PN3 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim26Q99PN3 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim26Q99PN3 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim26Q99PN3 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim26Q99PN3 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Trim26Q99PN3 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.1 ms