Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3L8

Cdk8, Cyclin-dependent kinase 8, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk8Q8R3L8 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cdk8Q8R3L8 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cdk8Q8R3L8 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cdk8Q8R3L8 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cdk8Q8R3L8 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Cdk8Q8R3L8 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Cdk8Q8R3L8 Gm12899-201ENSMUST00000120565 551 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Cdk8Q8R3L8 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cdk8Q8R3L8 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Cdk8Q8R3L8 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cdk8Q8R3L8 Gm17825-201ENSMUST00000206836 794 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Cdk8Q8R3L8 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cdk8Q8R3L8 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Cdk8Q8R3L8 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cdk8Q8R3L8 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cdk8Q8R3L8 Krtap6-2-201ENSMUST00000082065 786 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cdk8Q8R3L8 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cdk8Q8R3L8 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cdk8Q8R3L8 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cdk8Q8R3L8 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cdk8Q8R3L8 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cdk8Q8R3L8 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cdk8Q8R3L8 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cdk8Q8R3L8 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cdk8Q8R3L8 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cdk8Q8R3L8 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cdk8Q8R3L8 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cdk8Q8R3L8 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cdk8Q8R3L8 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cdk8Q8R3L8 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cdk8Q8R3L8 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cdk8Q8R3L8 Gm21358-201ENSMUST00000191645 1659 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Cdk8Q8R3L8 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cdk8Q8R3L8 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cdk8Q8R3L8 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cdk8Q8R3L8 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cdk8Q8R3L8 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cdk8Q8R3L8 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cdk8Q8R3L8 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Cdk8Q8R3L8 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cdk8Q8R3L8 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cdk8Q8R3L8 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Cdk8Q8R3L8 Gm16195-201ENSMUST00000130607 442 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cdk8Q8R3L8 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cdk8Q8R3L8 H1foo-203ENSMUST00000161969 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cdk8Q8R3L8 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cdk8Q8R3L8 Gm5778-201ENSMUST00000171003 1072 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Cdk8Q8R3L8 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cdk8Q8R3L8 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cdk8Q8R3L8 Gm28388-201ENSMUST00000186262 437 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Cdk8Q8R3L8 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cdk8Q8R3L8 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cdk8Q8R3L8 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cdk8Q8R3L8 Gm2875-201ENSMUST00000211333 360 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Cdk8Q8R3L8 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cdk8Q8R3L8 AC118476.3-201ENSMUST00000216419 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cdk8Q8R3L8 Gm9661-201ENSMUST00000221611 1122 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Cdk8Q8R3L8 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Cdk8Q8R3L8 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cdk8Q8R3L8 Gm23105-201ENSMUST00000083719 134 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Cdk8Q8R3L8 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cdk8Q8R3L8 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cdk8Q8R3L8 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cdk8Q8R3L8 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cdk8Q8R3L8 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cdk8Q8R3L8 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Cdk8Q8R3L8 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cdk8Q8R3L8 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cdk8Q8R3L8 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cdk8Q8R3L8 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cdk8Q8R3L8 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cdk8Q8R3L8 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cdk8Q8R3L8 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cdk8Q8R3L8 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cdk8Q8R3L8 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cdk8Q8R3L8 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cdk8Q8R3L8 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cdk8Q8R3L8 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cdk8Q8R3L8 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cdk8Q8R3L8 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cdk8Q8R3L8 Olfr22-ps1-201ENSMUST00000115991 1237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cdk8Q8R3L8 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Cdk8Q8R3L8 Gm12516-201ENSMUST00000120819 385 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Cdk8Q8R3L8 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cdk8Q8R3L8 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Cdk8Q8R3L8 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Cdk8Q8R3L8 Gm42657-201ENSMUST00000201746 211 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Cdk8Q8R3L8 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cdk8Q8R3L8 BC030499-201ENSMUST00000046361 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cdk8Q8R3L8 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cdk8Q8R3L8 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cdk8Q8R3L8 Bbs5-202ENSMUST00000112286 1397 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cdk8Q8R3L8 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cdk8Q8R3L8 Nrxn1-215ENSMUST00000173917 1439 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cdk8Q8R3L8 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cdk8Q8R3L8 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cdk8Q8R3L8 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cdk8Q8R3L8 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cdk8Q8R3L8 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cdk8Q8R3L8 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms