Protein–RNA interactions for Protein: Q8K330

Ssh3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, mousemouse

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Length 649 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh3Q8K330 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ssh3Q8K330 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Ssh3Q8K330 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ssh3Q8K330 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ssh3Q8K330 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Ssh3Q8K330 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ssh3Q8K330 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ssh3Q8K330 Grem1-201ENSMUST00000099575 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ssh3Q8K330 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ssh3Q8K330 Phc1-203ENSMUST00000112600 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ssh3Q8K330 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ssh3Q8K330 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ssh3Q8K330 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ssh3Q8K330 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ssh3Q8K330 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ssh3Q8K330 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ssh3Q8K330 Htr1d-203ENSMUST00000121571 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ssh3Q8K330 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ssh3Q8K330 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ssh3Q8K330 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ssh3Q8K330 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ssh3Q8K330 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ssh3Q8K330 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ssh3Q8K330 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Ssh3Q8K330 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ssh3Q8K330 Atp1a3-205ENSMUST00000196684 3642 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ssh3Q8K330 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ssh3Q8K330 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ssh3Q8K330 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ssh3Q8K330 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ssh3Q8K330 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ssh3Q8K330 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ssh3Q8K330 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ssh3Q8K330 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ssh3Q8K330 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ssh3Q8K330 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ssh3Q8K330 Pou3f4-201ENSMUST00000078229 2928 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ssh3Q8K330 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ssh3Q8K330 Irak4-202ENSMUST00000109248 3437 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Ssh3Q8K330 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ssh3Q8K330 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ssh3Q8K330 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ssh3Q8K330 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ssh3Q8K330 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ssh3Q8K330 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Ssh3Q8K330 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Ssh3Q8K330 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Ssh3Q8K330 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ssh3Q8K330 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Ssh3Q8K330 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ssh3Q8K330 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ssh3Q8K330 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Ssh3Q8K330 Kcnh3-201ENSMUST00000041415 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Ssh3Q8K330 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Ssh3Q8K330 Man2b2-201ENSMUST00000031002 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Ssh3Q8K330 Cryz-201ENSMUST00000029850 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ssh3Q8K330 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ssh3Q8K330 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ssh3Q8K330 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Ssh3Q8K330 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ssh3Q8K330 Brd1-202ENSMUST00000109380 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ssh3Q8K330 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ssh3Q8K330 Zfp384-205ENSMUST00000112424 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Ssh3Q8K330 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ssh3Q8K330 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ssh3Q8K330 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ssh3Q8K330 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ssh3Q8K330 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ssh3Q8K330 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ssh3Q8K330 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ssh3Q8K330 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ssh3Q8K330 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ssh3Q8K330 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ssh3Q8K330 Ezr-201ENSMUST00000064234 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ssh3Q8K330 AC160562.2-201ENSMUST00000216374 2201 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ssh3Q8K330 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ssh3Q8K330 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ssh3Q8K330 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ssh3Q8K330 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ssh3Q8K330 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ssh3Q8K330 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ssh3Q8K330 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
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