Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5T8

Ccdc113, Coiled-coil domain-containing protein 113, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc113Q8C5T8 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Ccdc113Q8C5T8 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc113Q8C5T8 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc113Q8C5T8 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc113Q8C5T8 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc113Q8C5T8 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc113Q8C5T8 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc113Q8C5T8 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Ccdc113Q8C5T8 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc113Q8C5T8 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Ccdc113Q8C5T8 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc113Q8C5T8 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc113Q8C5T8 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Ccdc113Q8C5T8 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Ccdc113Q8C5T8 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc113Q8C5T8 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc113Q8C5T8 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Ccdc113Q8C5T8 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Ccdc113Q8C5T8 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Ccdc113Q8C5T8 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Ccdc113Q8C5T8 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Ccdc113Q8C5T8 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Ccdc113Q8C5T8 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Ccdc113Q8C5T8 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
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Ccdc113Q8C5T8 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
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Ccdc113Q8C5T8 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ccdc113Q8C5T8 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
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Ccdc113Q8C5T8 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ccdc113Q8C5T8 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ccdc113Q8C5T8 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Ccdc113Q8C5T8 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc113Q8C5T8 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Ccdc113Q8C5T8 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
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