Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3L1

Ssuh2, Protein SSUH2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssuh2Q8C3L1 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 Mocs2-205ENSMUST00000165022 962 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 Clrn1-201ENSMUST00000051408 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 9430064I24Rik-201ENSMUST00000206516 2669 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 Rad54b-203ENSMUST00000108306 652 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 Gm6461-201ENSMUST00000120015 633 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 Gm29011-201ENSMUST00000191059 712 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 AC136986.1-201ENSMUST00000222829 380 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 Ccl25-201ENSMUST00000024004 1058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Ssuh2Q8C3L1 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ssuh2Q8C3L1 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ssuh2Q8C3L1 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ssuh2Q8C3L1 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ssuh2Q8C3L1 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ssuh2Q8C3L1 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.4 ms