Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX3

Krt40, Keratin, type I cytoskeletal 40, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt40Q6IFX3 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Krt40Q6IFX3 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Krt40Q6IFX3 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Krt40Q6IFX3 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Krt40Q6IFX3 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Krt40Q6IFX3 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Krt40Q6IFX3 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Krt40Q6IFX3 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Krt40Q6IFX3 Gm10479-201ENSMUST00000101568 318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Krt40Q6IFX3 Polr2i-203ENSMUST00000108193 488 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Krt40Q6IFX3 Gm15374-201ENSMUST00000119313 844 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Krt40Q6IFX3 Gm14395-201ENSMUST00000120494 563 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Krt40Q6IFX3 Gm15329-201ENSMUST00000121408 155 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Krt40Q6IFX3 2810408I11Rik-201ENSMUST00000122813 435 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Krt40Q6IFX3 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Krt40Q6IFX3 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Krt40Q6IFX3 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Krt40Q6IFX3 Gm15523-201ENSMUST00000160463 439 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Krt40Q6IFX3 Tro-208ENSMUST00000164071 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Krt40Q6IFX3 Gm5778-201ENSMUST00000171003 1072 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Krt40Q6IFX3 Gm27232-201ENSMUST00000184373 597 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Krt40Q6IFX3 Pdcd5-ps-201ENSMUST00000191699 381 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Krt40Q6IFX3 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Krt40Q6IFX3 Gm42657-201ENSMUST00000201746 211 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Krt40Q6IFX3 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Krt40Q6IFX3 Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 548 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Krt40Q6IFX3 Gm46336-201ENSMUST00000221894 279 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Krt40Q6IFX3 Gm6685-201ENSMUST00000042595 764 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Krt40Q6IFX3 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Krt40Q6IFX3 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Krt40Q6IFX3 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Krt40Q6IFX3 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Krt40Q6IFX3 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Krt40Q6IFX3 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Krt40Q6IFX3 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Krt40Q6IFX3 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Krt40Q6IFX3 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Krt40Q6IFX3 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Krt40Q6IFX3 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Krt40Q6IFX3 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Krt40Q6IFX3 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Krt40Q6IFX3 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Krt40Q6IFX3 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Krt40Q6IFX3 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Krt40Q6IFX3 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Krt40Q6IFX3 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Krt40Q6IFX3 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Krt40Q6IFX3 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Krt40Q6IFX3 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Krt40Q6IFX3 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Krt40Q6IFX3 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Krt40Q6IFX3 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Krt40Q6IFX3 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Krt40Q6IFX3 Krtap4-6-201ENSMUST00000100476 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Krt40Q6IFX3 Gm26013-201ENSMUST00000104404 119 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Krt40Q6IFX3 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Krt40Q6IFX3 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Krt40Q6IFX3 Mrpl20-202ENSMUST00000130188 442 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Krt40Q6IFX3 Gm14236-201ENSMUST00000142374 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Krt40Q6IFX3 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Krt40Q6IFX3 Eef1b2-209ENSMUST00000188524 681 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Krt40Q6IFX3 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Krt40Q6IFX3 Gm34023-201ENSMUST00000195539 217 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Krt40Q6IFX3 Gm44158-201ENSMUST00000203881 505 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Krt40Q6IFX3 Gm6145-204ENSMUST00000210902 1266 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Krt40Q6IFX3 Olfr284-201ENSMUST00000063289 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Krt40Q6IFX3 Mirlet7i-201ENSMUST00000083472 85 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Krt40Q6IFX3 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Krt40Q6IFX3 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Krt40Q6IFX3 Anxa9-204ENSMUST00000164406 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Krt40Q6IFX3 Gm4900-201ENSMUST00000222046 1628 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Krt40Q6IFX3 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Krt40Q6IFX3 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Krt40Q6IFX3 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Krt40Q6IFX3 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Krt40Q6IFX3 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Krt40Q6IFX3 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Krt40Q6IFX3 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Krt40Q6IFX3 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Krt40Q6IFX3 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Krt40Q6IFX3 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Krt40Q6IFX3 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Krt40Q6IFX3 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Krt40Q6IFX3 Cipc-208ENSMUST00000189246 1454 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Krt40Q6IFX3 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Krt40Q6IFX3 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Krt40Q6IFX3 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Krt40Q6IFX3 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Krt40Q6IFX3 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Krt40Q6IFX3 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Krt40Q6IFX3 Clrn1-203ENSMUST00000072551 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Krt40Q6IFX3 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Krt40Q6IFX3 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Krt40Q6IFX3 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Krt40Q6IFX3 Mir1956-201ENSMUST00000157748 65 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Krt40Q6IFX3 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Krt40Q6IFX3 Rps28-203ENSMUST00000173019 437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Krt40Q6IFX3 Gm7271-202ENSMUST00000191515 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Krt40Q6IFX3 Gm17877-201ENSMUST00000192578 814 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Krt40Q6IFX3 Gm37826-201ENSMUST00000195329 322 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
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