Protein–RNA interactions for Protein: Q60973

Rbbp7, Histone-binding protein RBBP7, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp7Q60973 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rbbp7Q60973 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rbbp7Q60973 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rbbp7Q60973 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rbbp7Q60973 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rbbp7Q60973 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rbbp7Q60973 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rbbp7Q60973 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rbbp7Q60973 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rbbp7Q60973 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Rbbp7Q60973 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rbbp7Q60973 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rbbp7Q60973 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rbbp7Q60973 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rbbp7Q60973 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Rbbp7Q60973 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rbbp7Q60973 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Rbbp7Q60973 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Rbbp7Q60973 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rbbp7Q60973 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rbbp7Q60973 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rbbp7Q60973 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rbbp7Q60973 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rbbp7Q60973 Adamts9-201ENSMUST00000113438 8016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rbbp7Q60973 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rbbp7Q60973 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rbbp7Q60973 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rbbp7Q60973 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rbbp7Q60973 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rbbp7Q60973 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rbbp7Q60973 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Rbbp7Q60973 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rbbp7Q60973 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rbbp7Q60973 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rbbp7Q60973 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rbbp7Q60973 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rbbp7Q60973 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rbbp7Q60973 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rbbp7Q60973 Bcl9l-203ENSMUST00000218183 6771 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rbbp7Q60973 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rbbp7Q60973 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rbbp7Q60973 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rbbp7Q60973 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rbbp7Q60973 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Rbbp7Q60973 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rbbp7Q60973 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rbbp7Q60973 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rbbp7Q60973 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rbbp7Q60973 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Rbbp7Q60973 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rbbp7Q60973 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Rbbp7Q60973 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rbbp7Q60973 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rbbp7Q60973 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rbbp7Q60973 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rbbp7Q60973 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rbbp7Q60973 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rbbp7Q60973 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rbbp7Q60973 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rbbp7Q60973 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rbbp7Q60973 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rbbp7Q60973 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rbbp7Q60973 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rbbp7Q60973 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rbbp7Q60973 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Rbbp7Q60973 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Rbbp7Q60973 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Rbbp7Q60973 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rbbp7Q60973 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rbbp7Q60973 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rbbp7Q60973 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rbbp7Q60973 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rbbp7Q60973 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rbbp7Q60973 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rbbp7Q60973 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Rbbp7Q60973 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rbbp7Q60973 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rbbp7Q60973 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rbbp7Q60973 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rbbp7Q60973 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Rbbp7Q60973 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rbbp7Q60973 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rbbp7Q60973 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Rbbp7Q60973 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rbbp7Q60973 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rbbp7Q60973 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Rbbp7Q60973 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rbbp7Q60973 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Rbbp7Q60973 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.55
Rbbp7Q60973 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rbbp7Q60973 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rbbp7Q60973 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rbbp7Q60973 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rbbp7Q60973 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rbbp7Q60973 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rbbp7Q60973 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rbbp7Q60973 Pde5a-201ENSMUST00000066728 6939 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rbbp7Q60973 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rbbp7Q60973 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rbbp7Q60973 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms