Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC9

Trim58, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM58, mousemouse

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Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim58Q5NCC9 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Trim58Q5NCC9 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim58Q5NCC9 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim58Q5NCC9 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
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Trim58Q5NCC9 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim58Q5NCC9 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim58Q5NCC9 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim58Q5NCC9 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim58Q5NCC9 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim58Q5NCC9 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim58Q5NCC9 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim58Q5NCC9 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim58Q5NCC9 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim58Q5NCC9 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
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