Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR0

Shisa3, Protein shisa-3 homolog, mousemouse

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Length 238 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisa3Q3UPR0 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Shisa3Q3UPR0 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Shisa3Q3UPR0 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Shisa3Q3UPR0 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Shisa3Q3UPR0 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Shisa3Q3UPR0 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Shisa3Q3UPR0 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Shisa3Q3UPR0 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Shisa3Q3UPR0 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Shisa3Q3UPR0 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Shisa3Q3UPR0 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Shisa3Q3UPR0 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Shisa3Q3UPR0 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Shisa3Q3UPR0 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Shisa3Q3UPR0 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Shisa3Q3UPR0 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Shisa3Q3UPR0 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Shisa3Q3UPR0 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Shisa3Q3UPR0 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Shisa3Q3UPR0 1110051M20Rik-201ENSMUST00000064652 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Shisa3Q3UPR0 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Shisa3Q3UPR0 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Shisa3Q3UPR0 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Shisa3Q3UPR0 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Shisa3Q3UPR0 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Shisa3Q3UPR0 Rasal1-201ENSMUST00000031606 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Shisa3Q3UPR0 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Shisa3Q3UPR0 2810006K23Rik-201ENSMUST00000077376 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Shisa3Q3UPR0 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Shisa3Q3UPR0 Flicr-201ENSMUST00000144719 3455 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Shisa3Q3UPR0 Oxct1-201ENSMUST00000110690 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Shisa3Q3UPR0 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Shisa3Q3UPR0 Gm20755-201ENSMUST00000196893 1827 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Shisa3Q3UPR0 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Shisa3Q3UPR0 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Shisa3Q3UPR0 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Shisa3Q3UPR0 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Shisa3Q3UPR0 Synpr-201ENSMUST00000070323 2541 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Shisa3Q3UPR0 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Shisa3Q3UPR0 Man2b2-201ENSMUST00000031002 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Shisa3Q3UPR0 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Shisa3Q3UPR0 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Shisa3Q3UPR0 Vipr2-201ENSMUST00000011315 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Shisa3Q3UPR0 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Shisa3Q3UPR0 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Shisa3Q3UPR0 Rad51ap2-201ENSMUST00000124065 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Shisa3Q3UPR0 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Shisa3Q3UPR0 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Shisa3Q3UPR0 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Shisa3Q3UPR0 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Shisa3Q3UPR0 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Shisa3Q3UPR0 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Shisa3Q3UPR0 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Shisa3Q3UPR0 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Shisa3Q3UPR0 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Shisa3Q3UPR0 1700065O20Rik-201ENSMUST00000186872 710 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Shisa3Q3UPR0 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Shisa3Q3UPR0 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Shisa3Q3UPR0 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Shisa3Q3UPR0 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Shisa3Q3UPR0 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Shisa3Q3UPR0 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Shisa3Q3UPR0 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Shisa3Q3UPR0 Gm10646-201ENSMUST00000213227 3293 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
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Shisa3Q3UPR0 Olfr1495-202ENSMUST00000215930 2025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Shisa3Q3UPR0 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Shisa3Q3UPR0 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Shisa3Q3UPR0 Gm19540-201ENSMUST00000221843 810 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Shisa3Q3UPR0 AC154806.5-202ENSMUST00000227217 1443 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Shisa3Q3UPR0 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Shisa3Q3UPR0 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Shisa3Q3UPR0 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Shisa3Q3UPR0 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Shisa3Q3UPR0 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Shisa3Q3UPR0 Olfr765-201ENSMUST00000071559 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Shisa3Q3UPR0 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Shisa3Q3UPR0 BC028528-202ENSMUST00000090476 809 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Shisa3Q3UPR0 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Shisa3Q3UPR0 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Shisa3Q3UPR0 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Shisa3Q3UPR0 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Shisa3Q3UPR0 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Shisa3Q3UPR0 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Shisa3Q3UPR0 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Shisa3Q3UPR0 D930020B18Rik-201ENSMUST00000120642 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Shisa3Q3UPR0 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Shisa3Q3UPR0 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Shisa3Q3UPR0 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Shisa3Q3UPR0 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Shisa3Q3UPR0 Gm42141-201ENSMUST00000196534 2172 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Shisa3Q3UPR0 Gm26660-202ENSMUST00000223620 4112 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Shisa3Q3UPR0 Elovl7-201ENSMUST00000022207 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Shisa3Q3UPR0 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Shisa3Q3UPR0 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Shisa3Q3UPR0 Mroh8-202ENSMUST00000143663 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Shisa3Q3UPR0 Ctcfl-202ENSMUST00000179693 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Shisa3Q3UPR0 Tnip1-203ENSMUST00000102731 2973 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Shisa3Q3UPR0 Cpne9-201ENSMUST00000041203 2777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Shisa3Q3UPR0 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
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