Protein–RNA interactions for Protein: Q3LRV9

Treml4, Trem-like transcript 4 protein, mousemouse

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Length 263 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Treml4Q3LRV9 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 Mirlet7i-201ENSMUST00000083472 85 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 1810014B01Rik-202ENSMUST00000218095 1622 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 Mum1l1-204ENSMUST00000113045 4523 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 Yipf6-202ENSMUST00000113811 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 Gm12813-201ENSMUST00000119615 902 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 Gm1848-201ENSMUST00000120711 789 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 Gm13182-201ENSMUST00000122241 312 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 Gm15523-201ENSMUST00000160463 439 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 Gm18351-201ENSMUST00000188646 883 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 Gm16833-202ENSMUST00000189204 672 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 Gm37299-201ENSMUST00000193951 826 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 Gm19166-201ENSMUST00000196041 1063 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 AC136986.1-201ENSMUST00000222829 380 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 Olfr284-201ENSMUST00000063289 918 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Treml4Q3LRV9 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 Cyp2s1-202ENSMUST00000108395 3161 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Treml4Q3LRV9 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 Rpap2-204ENSMUST00000112654 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 Ccdc60-202ENSMUST00000086483 2168 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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