Protein–RNA interactions for Protein: Q03358

Msx2, Homeobox protein MSX-2, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx2Q03358 Gm28042-203ENSMUST00000156805 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 Gm44415-201ENSMUST00000204151 2112 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 Cpt1c-201ENSMUST00000063761 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 Nfe2l1-212ENSMUST00000169828 3530 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 Asb6-201ENSMUST00000041726 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 Mettl14-204ENSMUST00000174323 4202 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 Zfp280b-201ENSMUST00000061617 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 Ccdc96-201ENSMUST00000060100 3585 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 Lima1-201ENSMUST00000073691 4215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 Rpap2-204ENSMUST00000112654 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 Fastkd5-201ENSMUST00000110262 3015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 Gm21156-201ENSMUST00000189693 869 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 Gaa-201ENSMUST00000026666 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 Prkcd-205ENSMUST00000112207 2139 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 Spice1-201ENSMUST00000050897 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 Pigq-219ENSMUST00000208071 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 Gtf2i-216ENSMUST00000173888 2820 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 Krba1-201ENSMUST00000031815 3685 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 9430015G10Rik-201ENSMUST00000072554 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 Gm39317-201ENSMUST00000213360 1138 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 Nfx1-203ENSMUST00000098143 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 Il27ra-201ENSMUST00000005601 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 Dhdds-201ENSMUST00000012262 3133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 Corin-207ENSMUST00000177290 2943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Msx2Q03358 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms