Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Gmps-201ENSMUST00000029405 8105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Carns1-201ENSMUST00000167055 3968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Zfp174-201ENSMUST00000041778 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 C4b-201ENSMUST00000069507 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Il1rap-202ENSMUST00000096129 4438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.26□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC8.26□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC8.26□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC8.26□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Cox15-201ENSMUST00000045562 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Myo18a-223ENSMUST00000169105 6475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.26□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Sel1l-201ENSMUST00000021347 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Thbs2-201ENSMUST00000170872 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.25□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Zdhhc3-208ENSMUST00000147563 6987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC8.25□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.25□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
PrcdQ00LT2 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms