Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gjb2Q00977 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Gjb2Q00977 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gjb2Q00977 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gjb2Q00977 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gjb2Q00977 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gjb2Q00977 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gjb2Q00977 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gjb2Q00977 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gjb2Q00977 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gjb2Q00977 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Gjb2Q00977 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gjb2Q00977 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gjb2Q00977 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gjb2Q00977 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gjb2Q00977 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gjb2Q00977 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Gjb2Q00977 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gjb2Q00977 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gjb2Q00977 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gjb2Q00977 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gjb2Q00977 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gjb2Q00977 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gjb2Q00977 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gjb2Q00977 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gjb2Q00977 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gjb2Q00977 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gjb2Q00977 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gjb2Q00977 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gjb2Q00977 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gjb2Q00977 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gjb2Q00977 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Gjb2Q00977 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Gjb2Q00977 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Gjb2Q00977 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Gjb2Q00977 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Gjb2Q00977 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Gjb2Q00977 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Gjb2Q00977 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Gjb2Q00977 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Gjb2Q00977 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Gjb2Q00977 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Gjb2Q00977 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Gjb2Q00977 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gjb2Q00977 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gjb2Q00977 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gjb2Q00977 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gjb2Q00977 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gjb2Q00977 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gjb2Q00977 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gjb2Q00977 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gjb2Q00977 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gjb2Q00977 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gjb2Q00977 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gjb2Q00977 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gjb2Q00977 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gjb2Q00977 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gjb2Q00977 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Gjb2Q00977 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gjb2Q00977 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gjb2Q00977 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gjb2Q00977 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gjb2Q00977 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gjb2Q00977 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gjb2Q00977 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gjb2Q00977 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Gjb2Q00977 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Gjb2Q00977 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Gjb2Q00977 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gjb2Q00977 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gjb2Q00977 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gjb2Q00977 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gjb2Q00977 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gjb2Q00977 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gjb2Q00977 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gjb2Q00977 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gjb2Q00977 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gjb2Q00977 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gjb2Q00977 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gjb2Q00977 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gjb2Q00977 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gjb2Q00977 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gjb2Q00977 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gjb2Q00977 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Gjb2Q00977 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gjb2Q00977 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Gjb2Q00977 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Gjb2Q00977 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gjb2Q00977 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gjb2Q00977 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gjb2Q00977 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gjb2Q00977 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gjb2Q00977 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gjb2Q00977 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gjb2Q00977 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gjb2Q00977 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gjb2Q00977 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gjb2Q00977 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Gjb2Q00977 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gjb2Q00977 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms