Protein–RNA interactions for Protein: P61961

Ufm1, Ubiquitin-fold modifier 1, mousemouse

Predictions only

Length 85 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufm1P61961 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ufm1P61961 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ufm1P61961 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ufm1P61961 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ufm1P61961 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ufm1P61961 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ufm1P61961 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ufm1P61961 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Ufm1P61961 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ufm1P61961 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ufm1P61961 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ufm1P61961 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ufm1P61961 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ufm1P61961 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ufm1P61961 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ufm1P61961 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Ufm1P61961 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ufm1P61961 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ufm1P61961 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ufm1P61961 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ufm1P61961 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ufm1P61961 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ufm1P61961 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ufm1P61961 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ufm1P61961 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Ufm1P61961 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Ufm1P61961 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ufm1P61961 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ufm1P61961 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ufm1P61961 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ufm1P61961 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ufm1P61961 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ufm1P61961 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ufm1P61961 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ufm1P61961 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ufm1P61961 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ufm1P61961 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ufm1P61961 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ufm1P61961 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ufm1P61961 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ufm1P61961 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ufm1P61961 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ufm1P61961 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ufm1P61961 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ufm1P61961 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ufm1P61961 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ufm1P61961 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ufm1P61961 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ufm1P61961 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ufm1P61961 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ufm1P61961 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ufm1P61961 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ufm1P61961 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ufm1P61961 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ufm1P61961 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ufm1P61961 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Ufm1P61961 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Ufm1P61961 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ufm1P61961 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ufm1P61961 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ufm1P61961 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ufm1P61961 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ufm1P61961 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Ufm1P61961 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Ufm1P61961 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ufm1P61961 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ufm1P61961 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ufm1P61961 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Ufm1P61961 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ufm1P61961 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Ufm1P61961 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ufm1P61961 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ufm1P61961 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Ufm1P61961 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ufm1P61961 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ufm1P61961 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Ufm1P61961 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ufm1P61961 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ufm1P61961 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ufm1P61961 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ufm1P61961 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ufm1P61961 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ufm1P61961 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ufm1P61961 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ufm1P61961 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ufm1P61961 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ufm1P61961 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ufm1P61961 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ufm1P61961 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ufm1P61961 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ufm1P61961 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ufm1P61961 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ufm1P61961 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ufm1P61961 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ufm1P61961 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ufm1P61961 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ufm1P61961 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ufm1P61961 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ufm1P61961 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ufm1P61961 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms