Protein–RNA interactions for Protein: P61622

Itga11, Integrin alpha-11, mousemouse

Predictions only

Length 1,188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga11P61622 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Itga11P61622 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Itga11P61622 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Itga11P61622 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Itga11P61622 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Itga11P61622 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Itga11P61622 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Itga11P61622 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Itga11P61622 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Itga11P61622 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Itga11P61622 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Itga11P61622 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Itga11P61622 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Itga11P61622 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Itga11P61622 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Itga11P61622 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Itga11P61622 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Itga11P61622 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Itga11P61622 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Itga11P61622 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Itga11P61622 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Itga11P61622 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Itga11P61622 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Itga11P61622 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Itga11P61622 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Itga11P61622 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Itga11P61622 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Itga11P61622 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Itga11P61622 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Itga11P61622 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Itga11P61622 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Itga11P61622 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Itga11P61622 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Itga11P61622 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Itga11P61622 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Itga11P61622 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Itga11P61622 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Itga11P61622 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Itga11P61622 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Itga11P61622 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Itga11P61622 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Itga11P61622 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Itga11P61622 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Itga11P61622 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Itga11P61622 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Itga11P61622 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Itga11P61622 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Itga11P61622 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Itga11P61622 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Itga11P61622 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Itga11P61622 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Itga11P61622 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Itga11P61622 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Itga11P61622 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Itga11P61622 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Itga11P61622 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Itga11P61622 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Itga11P61622 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Itga11P61622 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Itga11P61622 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Itga11P61622 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Itga11P61622 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Itga11P61622 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Itga11P61622 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Itga11P61622 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Itga11P61622 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Itga11P61622 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Itga11P61622 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Itga11P61622 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Itga11P61622 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Itga11P61622 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Itga11P61622 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Itga11P61622 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Itga11P61622 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Itga11P61622 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Itga11P61622 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Itga11P61622 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Itga11P61622 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Itga11P61622 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Itga11P61622 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Itga11P61622 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Itga11P61622 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Itga11P61622 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Itga11P61622 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Itga11P61622 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Itga11P61622 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Itga11P61622 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Itga11P61622 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Itga11P61622 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Itga11P61622 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Itga11P61622 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Itga11P61622 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Itga11P61622 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Itga11P61622 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Itga11P61622 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Itga11P61622 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Itga11P61622 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Itga11P61622 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Itga11P61622 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Itga11P61622 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.2 ms