Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SrprbP47758 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SrprbP47758 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SrprbP47758 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SrprbP47758 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SrprbP47758 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SrprbP47758 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SrprbP47758 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SrprbP47758 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SrprbP47758 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SrprbP47758 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SrprbP47758 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SrprbP47758 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SrprbP47758 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SrprbP47758 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SrprbP47758 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SrprbP47758 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SrprbP47758 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SrprbP47758 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SrprbP47758 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SrprbP47758 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SrprbP47758 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SrprbP47758 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SrprbP47758 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SrprbP47758 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SrprbP47758 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SrprbP47758 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SrprbP47758 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SrprbP47758 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SrprbP47758 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SrprbP47758 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SrprbP47758 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SrprbP47758 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SrprbP47758 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SrprbP47758 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SrprbP47758 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SrprbP47758 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SrprbP47758 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SrprbP47758 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SrprbP47758 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SrprbP47758 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SrprbP47758 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SrprbP47758 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SrprbP47758 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SrprbP47758 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SrprbP47758 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SrprbP47758 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SrprbP47758 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SrprbP47758 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SrprbP47758 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SrprbP47758 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SrprbP47758 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SrprbP47758 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SrprbP47758 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SrprbP47758 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SrprbP47758 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SrprbP47758 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SrprbP47758 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SrprbP47758 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SrprbP47758 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
SrprbP47758 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SrprbP47758 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SrprbP47758 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SrprbP47758 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SrprbP47758 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SrprbP47758 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SrprbP47758 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SrprbP47758 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
SrprbP47758 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SrprbP47758 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SrprbP47758 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SrprbP47758 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SrprbP47758 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SrprbP47758 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SrprbP47758 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SrprbP47758 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SrprbP47758 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SrprbP47758 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SrprbP47758 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SrprbP47758 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SrprbP47758 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SrprbP47758 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SrprbP47758 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SrprbP47758 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SrprbP47758 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SrprbP47758 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SrprbP47758 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SrprbP47758 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SrprbP47758 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SrprbP47758 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SrprbP47758 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SrprbP47758 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SrprbP47758 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SrprbP47758 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SrprbP47758 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SrprbP47758 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SrprbP47758 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SrprbP47758 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SrprbP47758 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SrprbP47758 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms