Protein–RNA interactions for Protein: P28310

Defa3, Alpha-defensin 3, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa3P28310 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Defa3P28310 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Defa3P28310 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
Defa3P28310 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Defa3P28310 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
Defa3P28310 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Defa3P28310 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Defa3P28310 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Defa3P28310 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Defa3P28310 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
Defa3P28310 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Defa3P28310 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Defa3P28310 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Defa3P28310 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Defa3P28310 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Defa3P28310 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Defa3P28310 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Defa3P28310 AC164161.2-201ENSMUST00000217446 1730 ntTSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Defa3P28310 Zswim9-201ENSMUST00000108532 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Defa3P28310 Lhx9-201ENSMUST00000019374 4937 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Defa3P28310 Dync1i2-201ENSMUST00000081710 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Defa3P28310 Shank2-201ENSMUST00000097929 4418 ntTSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Defa3P28310 Loxl4-201ENSMUST00000026190 3738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Defa3P28310 Ralgps1-204ENSMUST00000113165 6192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Defa3P28310 March1-207ENSMUST00000110258 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Defa3P28310 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Defa3P28310 Atp2b2-202ENSMUST00000101044 4586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Defa3P28310 Stat5a-201ENSMUST00000004145 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Defa3P28310 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Defa3P28310 Tnfrsf9-201ENSMUST00000030808 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Defa3P28310 Pabpc4-201ENSMUST00000078734 2700 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Defa3P28310 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Defa3P28310 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Defa3P28310 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Defa3P28310 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Defa3P28310 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Defa3P28310 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Defa3P28310 Glt1d1-201ENSMUST00000118139 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Defa3P28310 Gmip-202ENSMUST00000123453 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Defa3P28310 1700030K09Rik-202ENSMUST00000121902 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Defa3P28310 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Defa3P28310 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Defa3P28310 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
Defa3P28310 Ccdc40-201ENSMUST00000035935 4979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Defa3P28310 AC207128.2-201ENSMUST00000223708 1924 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
Defa3P28310 Icam1-201ENSMUST00000086399 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Defa3P28310 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Defa3P28310 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Defa3P28310 Pde2a-204ENSMUST00000209537 4100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Defa3P28310 D630003M21Rik-202ENSMUST00000103121 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Defa3P28310 A430105I19Rik-201ENSMUST00000059997 4703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Defa3P28310 Eea1-201ENSMUST00000053484 7749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Defa3P28310 Ptpn21-201ENSMUST00000085116 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Defa3P28310 Rsrc2-202ENSMUST00000057795 2270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Defa3P28310 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Defa3P28310 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
Defa3P28310 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
Defa3P28310 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Defa3P28310 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Defa3P28310 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Defa3P28310 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Defa3P28310 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
Defa3P28310 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
Defa3P28310 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Defa3P28310 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
Defa3P28310 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Defa3P28310 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Defa3P28310 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Defa3P28310 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Defa3P28310 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
Defa3P28310 Serpinb8-202ENSMUST00000112706 4581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Defa3P28310 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Defa3P28310 Dglucy-204ENSMUST00000110073 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Defa3P28310 C130060K24Rik-203ENSMUST00000170608 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Defa3P28310 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Defa3P28310 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
Defa3P28310 Dhdds-201ENSMUST00000012262 3133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Defa3P28310 Pex26-203ENSMUST00000120066 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Defa3P28310 Galnt15-201ENSMUST00000022460 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Defa3P28310 Mfn2-204ENSMUST00000105716 4241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Defa3P28310 Prkd2-202ENSMUST00000168093 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Defa3P28310 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Defa3P28310 Tldc1-201ENSMUST00000049156 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Defa3P28310 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Defa3P28310 Dusp16-202ENSMUST00000129433 3993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Defa3P28310 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Defa3P28310 Tmem19-201ENSMUST00000092170 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Defa3P28310 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Defa3P28310 Ralgapb-202ENSMUST00000109485 6709 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Defa3P28310 Zfp280b-201ENSMUST00000061617 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Defa3P28310 Glb1l2-207ENSMUST00000162702 2555 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Defa3P28310 Spata5-202ENSMUST00000108112 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Defa3P28310 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Defa3P28310 Adar-204ENSMUST00000118341 2399 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Defa3P28310 Npc1l1-201ENSMUST00000004505 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Defa3P28310 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Defa3P28310 Mybph-202ENSMUST00000191577 2320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
Defa3P28310 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Defa3P28310 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Defa3P28310 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 111.3 ms