Protein–RNA interactions for Protein: P21841

Sftpc, Pulmonary surfactant-associated protein C, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpcP21841 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SftpcP21841 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SftpcP21841 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SftpcP21841 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SftpcP21841 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SftpcP21841 Olfr431-ps1-201ENSMUST00000192435 544 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SftpcP21841 2310074N15Rik-201ENSMUST00000198276 582 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SftpcP21841 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SftpcP21841 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SftpcP21841 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SftpcP21841 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SftpcP21841 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SftpcP21841 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SftpcP21841 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SftpcP21841 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SftpcP21841 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SftpcP21841 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SftpcP21841 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SftpcP21841 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SftpcP21841 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SftpcP21841 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SftpcP21841 Slc38a3-203ENSMUST00000177567 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SftpcP21841 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SftpcP21841 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SftpcP21841 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SftpcP21841 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SftpcP21841 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SftpcP21841 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SftpcP21841 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SftpcP21841 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SftpcP21841 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SftpcP21841 Olfr464-205ENSMUST00000217112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SftpcP21841 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SftpcP21841 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SftpcP21841 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SftpcP21841 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
SftpcP21841 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SftpcP21841 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SftpcP21841 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SftpcP21841 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SftpcP21841 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SftpcP21841 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SftpcP21841 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SftpcP21841 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SftpcP21841 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SftpcP21841 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SftpcP21841 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SftpcP21841 Gm11470-201ENSMUST00000118868 1475 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
SftpcP21841 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SftpcP21841 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SftpcP21841 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
SftpcP21841 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SftpcP21841 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SftpcP21841 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SftpcP21841 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SftpcP21841 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
SftpcP21841 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SftpcP21841 Cntrobos-201ENSMUST00000132834 383 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SftpcP21841 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SftpcP21841 Gm27232-201ENSMUST00000184373 597 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SftpcP21841 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
SftpcP21841 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SftpcP21841 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SftpcP21841 1110019B22Rik-202ENSMUST00000218396 989 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SftpcP21841 AC159376.1-201ENSMUST00000218504 630 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
SftpcP21841 1700012P22Rik-201ENSMUST00000030323 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SftpcP21841 Gm25201-201ENSMUST00000083093 170 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
SftpcP21841 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SftpcP21841 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SftpcP21841 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SftpcP21841 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SftpcP21841 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SftpcP21841 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SftpcP21841 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SftpcP21841 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SftpcP21841 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
SftpcP21841 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SftpcP21841 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SftpcP21841 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SftpcP21841 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SftpcP21841 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SftpcP21841 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SftpcP21841 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
SftpcP21841 Fam180a-201ENSMUST00000051176 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SftpcP21841 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SftpcP21841 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SftpcP21841 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SftpcP21841 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SftpcP21841 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SftpcP21841 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SftpcP21841 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SftpcP21841 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SftpcP21841 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SftpcP21841 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SftpcP21841 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SftpcP21841 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SftpcP21841 Gm38115-201ENSMUST00000194317 2413 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SftpcP21841 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SftpcP21841 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SftpcP21841 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms