Protein–RNA interactions for Protein: P18828

Sdc1, Syndecan-1, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc1P18828 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Sdc1P18828 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Sdc1P18828 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Sdc1P18828 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Sdc1P18828 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Sdc1P18828 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Sdc1P18828 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Sdc1P18828 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Sdc1P18828 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Sdc1P18828 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Sdc1P18828 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Sdc1P18828 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Sdc1P18828 Thsd4-201ENSMUST00000034829 4816 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Sdc1P18828 Ankrd1-201ENSMUST00000025718 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Sdc1P18828 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Sdc1P18828 Samd4-206ENSMUST00000137543 6874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Sdc1P18828 Cln8-201ENSMUST00000027554 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Sdc1P18828 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Sdc1P18828 Gm26737-201ENSMUST00000181106 2151 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Sdc1P18828 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Sdc1P18828 C4b-201ENSMUST00000069507 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Sdc1P18828 Ifih1-201ENSMUST00000028259 5470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Sdc1P18828 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Sdc1P18828 1700018A04Rik-204ENSMUST00000221561 2569 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Sdc1P18828 Clasp2-201ENSMUST00000111838 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Sdc1P18828 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Sdc1P18828 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Sdc1P18828 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Sdc1P18828 Fn1-203ENSMUST00000186129 7797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Sdc1P18828 Prpf40b-202ENSMUST00000118287 3129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Sdc1P18828 Fmod-201ENSMUST00000048183 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Sdc1P18828 Adcy6-201ENSMUST00000096224 6038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Sdc1P18828 Cacna1c-224ENSMUST00000219018 7516 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Sdc1P18828 Srrm4-201ENSMUST00000076124 7472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Sdc1P18828 Ddx3x-201ENSMUST00000000804 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Sdc1P18828 Megf11-202ENSMUST00000093829 3652 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Sdc1P18828 Atp1a2-202ENSMUST00000097464 3186 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Sdc1P18828 Hmbox1-205ENSMUST00000176128 2958 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Sdc1P18828 Adar-204ENSMUST00000118341 2399 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Sdc1P18828 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Sdc1P18828 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Sdc1P18828 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Sdc1P18828 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Sdc1P18828 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Sdc1P18828 Nfkbiz-201ENSMUST00000036273 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Sdc1P18828 Psd-201ENSMUST00000041391 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Sdc1P18828 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Sdc1P18828 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Sdc1P18828 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Sdc1P18828 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Sdc1P18828 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Sdc1P18828 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Sdc1P18828 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Sdc1P18828 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Sdc1P18828 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Sdc1P18828 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Sdc1P18828 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Sdc1P18828 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Sdc1P18828 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Sdc1P18828 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Sdc1P18828 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Sdc1P18828 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Sdc1P18828 Stat5a-202ENSMUST00000107356 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Sdc1P18828 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Sdc1P18828 Ncam1-203ENSMUST00000192584 2525 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Sdc1P18828 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Sdc1P18828 Brat1-203ENSMUST00000110806 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Sdc1P18828 Sgk3-203ENSMUST00000168907 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Sdc1P18828 Fbxo8-201ENSMUST00000040218 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Sdc1P18828 Tank-203ENSMUST00000112495 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Sdc1P18828 Mcf2l-222ENSMUST00000173099 6081 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Sdc1P18828 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Sdc1P18828 Slc13a5-202ENSMUST00000137701 1746 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Sdc1P18828 Zfp384-204ENSMUST00000088308 2875 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Sdc1P18828 Serac1-202ENSMUST00000097432 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Sdc1P18828 Fam180a-201ENSMUST00000051176 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Sdc1P18828 Xirp1-201ENSMUST00000111635 5839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Sdc1P18828 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Sdc1P18828 Ano10-203ENSMUST00000214409 2384 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Sdc1P18828 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Sdc1P18828 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Sdc1P18828 Fam109b-203ENSMUST00000161178 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Sdc1P18828 Atp9b-201ENSMUST00000091790 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Sdc1P18828 Apobec3-205ENSMUST00000175752 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Sdc1P18828 Ints10-201ENSMUST00000034328 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Sdc1P18828 Dglucy-204ENSMUST00000110073 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Sdc1P18828 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Sdc1P18828 Magee2-201ENSMUST00000033575 2316 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Sdc1P18828 Gpatch2-204ENSMUST00000110943 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Sdc1P18828 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Sdc1P18828 Gpc4-201ENSMUST00000033450 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Sdc1P18828 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Sdc1P18828 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Sdc1P18828 Nf2-202ENSMUST00000056290 2394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Sdc1P18828 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Sdc1P18828 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Sdc1P18828 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Sdc1P18828 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Sdc1P18828 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Sdc1P18828 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms