Protein–RNA interactions for Protein: P13379

Cd5, T-cell surface glycoprotein CD5, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd5P13379 CT025551.1-201ENSMUST00000223996 692 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Cd5P13379 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cd5P13379 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cd5P13379 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cd5P13379 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cd5P13379 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cd5P13379 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cd5P13379 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cd5P13379 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cd5P13379 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cd5P13379 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cd5P13379 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cd5P13379 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cd5P13379 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cd5P13379 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cd5P13379 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cd5P13379 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cd5P13379 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cd5P13379 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cd5P13379 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cd5P13379 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cd5P13379 Tfrc-201ENSMUST00000023486 4890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cd5P13379 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cd5P13379 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cd5P13379 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Cd5P13379 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cd5P13379 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cd5P13379 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cd5P13379 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cd5P13379 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cd5P13379 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cd5P13379 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cd5P13379 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cd5P13379 Pcnp-203ENSMUST00000119981 901 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cd5P13379 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Cd5P13379 Gm4879-201ENSMUST00000122190 1272 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Cd5P13379 Gm12798-201ENSMUST00000124786 666 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cd5P13379 Gm11211-201ENSMUST00000143618 359 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cd5P13379 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cd5P13379 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cd5P13379 Gm20714-202ENSMUST00000176436 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cd5P13379 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Cd5P13379 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Cd5P13379 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cd5P13379 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cd5P13379 Gm31166-202ENSMUST00000210638 1268 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cd5P13379 Gm3028-201ENSMUST00000213805 1119 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Cd5P13379 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cd5P13379 Gm3285-201ENSMUST00000218443 908 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cd5P13379 AC155712.2-201ENSMUST00000220398 643 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cd5P13379 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cd5P13379 Nop10-201ENSMUST00000028553 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cd5P13379 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cd5P13379 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cd5P13379 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cd5P13379 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cd5P13379 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cd5P13379 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Cd5P13379 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cd5P13379 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cd5P13379 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cd5P13379 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Cd5P13379 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cd5P13379 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cd5P13379 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cd5P13379 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cd5P13379 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cd5P13379 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cd5P13379 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cd5P13379 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cd5P13379 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cd5P13379 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cd5P13379 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cd5P13379 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cd5P13379 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cd5P13379 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cd5P13379 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cd5P13379 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cd5P13379 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cd5P13379 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cd5P13379 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cd5P13379 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cd5P13379 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cd5P13379 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cd5P13379 Enpp7-202ENSMUST00000106273 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cd5P13379 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cd5P13379 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cd5P13379 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cd5P13379 Gm4993-201ENSMUST00000118719 1174 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Cd5P13379 Prss46-201ENSMUST00000119427 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cd5P13379 Gm12899-201ENSMUST00000120565 551 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Cd5P13379 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cd5P13379 Gm15619-201ENSMUST00000128415 1294 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cd5P13379 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cd5P13379 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cd5P13379 Mir1956-201ENSMUST00000157748 65 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Cd5P13379 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cd5P13379 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cd5P13379 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cd5P13379 Prss46-202ENSMUST00000176403 1257 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
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