Protein–RNA interactions for Protein: O08795

Prkcsh, Glucosidase 2 subunit beta, mousemouse

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Length 521 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcshO08795 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
PrkcshO08795 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
PrkcshO08795 Bfar-201ENSMUST00000023365 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
PrkcshO08795 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
PrkcshO08795 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
PrkcshO08795 Art4-201ENSMUST00000032341 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
PrkcshO08795 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PrkcshO08795 Lrrc49-210ENSMUST00000166168 2784 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PrkcshO08795 Sema4g-201ENSMUST00000026225 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PrkcshO08795 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PrkcshO08795 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PrkcshO08795 Nox4-201ENSMUST00000032781 3753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PrkcshO08795 Ccdc148-201ENSMUST00000077687 3977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PrkcshO08795 Atg13-201ENSMUST00000028678 3604 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PrkcshO08795 Npy4r-201ENSMUST00000052164 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PrkcshO08795 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PrkcshO08795 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PrkcshO08795 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
PrkcshO08795 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
PrkcshO08795 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PrkcshO08795 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PrkcshO08795 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PrkcshO08795 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
PrkcshO08795 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
PrkcshO08795 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PrkcshO08795 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PrkcshO08795 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PrkcshO08795 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
PrkcshO08795 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PrkcshO08795 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PrkcshO08795 Aldoart1-201ENSMUST00000078617 2052 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
PrkcshO08795 Gfpt1-201ENSMUST00000032057 2286 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PrkcshO08795 Gm44445-201ENSMUST00000204075 2683 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
PrkcshO08795 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PrkcshO08795 Top3a-203ENSMUST00000117743 2932 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PrkcshO08795 Eif3a-201ENSMUST00000025955 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PrkcshO08795 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
PrkcshO08795 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PrkcshO08795 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PrkcshO08795 B630019A10Rik-201ENSMUST00000149488 2407 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PrkcshO08795 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PrkcshO08795 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PrkcshO08795 Dgkh-201ENSMUST00000074729 3967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PrkcshO08795 Dcx-202ENSMUST00000087313 3120 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PrkcshO08795 Gm4894-202ENSMUST00000216428 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PrkcshO08795 Pcdh20-202ENSMUST00000192557 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PrkcshO08795 Strn-201ENSMUST00000024881 2967 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PrkcshO08795 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PrkcshO08795 Gm26724-201ENSMUST00000180434 1650 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PrkcshO08795 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PrkcshO08795 Akap1-202ENSMUST00000107903 3721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PrkcshO08795 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PrkcshO08795 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PrkcshO08795 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PrkcshO08795 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
PrkcshO08795 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PrkcshO08795 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
PrkcshO08795 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
PrkcshO08795 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PrkcshO08795 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PrkcshO08795 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PrkcshO08795 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
PrkcshO08795 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PrkcshO08795 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
PrkcshO08795 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PrkcshO08795 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
PrkcshO08795 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
PrkcshO08795 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PrkcshO08795 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PrkcshO08795 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PrkcshO08795 Cct3-201ENSMUST00000001452 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PrkcshO08795 C87436-202ENSMUST00000113698 2922 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PrkcshO08795 Olfr1261-203ENSMUST00000213909 2912 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PrkcshO08795 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PrkcshO08795 D030055H07Rik-201ENSMUST00000143956 2712 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PrkcshO08795 Arap1-203ENSMUST00000098243 3693 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PrkcshO08795 Clasp2-201ENSMUST00000111838 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PrkcshO08795 L3mbtl2-201ENSMUST00000023029 3487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PrkcshO08795 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PrkcshO08795 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PrkcshO08795 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PrkcshO08795 Gm17249-201ENSMUST00000181277 3500 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PrkcshO08795 4931406B18Rik-208ENSMUST00000191516 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PrkcshO08795 Celf3-213ENSMUST00000199775 2351 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PrkcshO08795 Gm43482-201ENSMUST00000202797 1861 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
PrkcshO08795 Olfr686-204ENSMUST00000216613 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PrkcshO08795 Mep1a-201ENSMUST00000024707 2921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PrkcshO08795 4933427I04Rik-201ENSMUST00000097896 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PrkcshO08795 Mdm4-206ENSMUST00000186617 4694 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PrkcshO08795 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PrkcshO08795 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PrkcshO08795 Zfp68-203ENSMUST00000110905 4749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PrkcshO08795 Serpina3f-203ENSMUST00000167049 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PrkcshO08795 Nudcd3-201ENSMUST00000066496 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PrkcshO08795 Evc-203ENSMUST00000114154 3695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PrkcshO08795 Tjp1-201ENSMUST00000032729 6102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PrkcshO08795 Rufy4-201ENSMUST00000080167 2306 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PrkcshO08795 Myom2-201ENSMUST00000033842 5075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PrkcshO08795 Meis1-201ENSMUST00000068264 3196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PrkcshO08795 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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