Protein–RNA interactions for Protein: B1AWN4

Atp10b, Phospholipid-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp10bB1AWN4 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp10bB1AWN4 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp10bB1AWN4 Nit1-203ENSMUST00000111296 1394 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp10bB1AWN4 Gm42970-201ENSMUST00000196407 1352 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp10bB1AWN4 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp10bB1AWN4 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp10bB1AWN4 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp10bB1AWN4 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp10bB1AWN4 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp10bB1AWN4 Gm3828-201ENSMUST00000121817 257 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp10bB1AWN4 Gm22344-201ENSMUST00000122642 278 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp10bB1AWN4 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp10bB1AWN4 Gm12000-201ENSMUST00000132007 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp10bB1AWN4 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp10bB1AWN4 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp10bB1AWN4 Ppy-202ENSMUST00000170554 487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp10bB1AWN4 9530085P06Rik-201ENSMUST00000182121 827 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp10bB1AWN4 Gm6358-202ENSMUST00000187643 489 ntAPPRIS P5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp10bB1AWN4 2610318N02Rik-202ENSMUST00000207116 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp10bB1AWN4 Rps2-ps12-201ENSMUST00000214262 785 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp10bB1AWN4 CT025603.1-201ENSMUST00000224040 448 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp10bB1AWN4 AC174797.2-201ENSMUST00000225835 165 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp10bB1AWN4 Fpr-rs3-201ENSMUST00000071189 1032 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp10bB1AWN4 Gm7589-201ENSMUST00000085631 534 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp10bB1AWN4 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp10bB1AWN4 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp10bB1AWN4 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp10bB1AWN4 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp10bB1AWN4 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp10bB1AWN4 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp10bB1AWN4 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp10bB1AWN4 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp10bB1AWN4 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp10bB1AWN4 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp10bB1AWN4 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp10bB1AWN4 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp10bB1AWN4 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp10bB1AWN4 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp10bB1AWN4 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp10bB1AWN4 Pex5l-203ENSMUST00000108221 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp10bB1AWN4 Cfap100-204ENSMUST00000134224 849 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp10bB1AWN4 A230006K03Rik-202ENSMUST00000154958 901 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp10bB1AWN4 Pax4-202ENSMUST00000164519 1229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp10bB1AWN4 Pax4-203ENSMUST00000171089 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp10bB1AWN4 Gm23647-201ENSMUST00000175042 109 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp10bB1AWN4 Rn5s-201ENSMUST00000177555 119 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp10bB1AWN4 n-R5s108-201ENSMUST00000177575 119 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp10bB1AWN4 n-R5s121-201ENSMUST00000177589 119 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp10bB1AWN4 n-R5s146-201ENSMUST00000177889 119 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp10bB1AWN4 Gm22109-201ENSMUST00000177995 119 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp10bB1AWN4 Gm22291-201ENSMUST00000178027 119 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp10bB1AWN4 n-R5s141-201ENSMUST00000178066 119 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp10bB1AWN4 Gm23284-201ENSMUST00000178069 119 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp10bB1AWN4 n-R5s100-201ENSMUST00000178106 119 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp10bB1AWN4 n-R5s111-201ENSMUST00000178203 119 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp10bB1AWN4 n-R5s105-201ENSMUST00000178499 119 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp10bB1AWN4 n-R5s149-201ENSMUST00000178520 119 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp10bB1AWN4 n-R5s103-201ENSMUST00000178755 119 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp10bB1AWN4 n-R5s123-201ENSMUST00000178804 119 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp10bB1AWN4 n-R5s142-201ENSMUST00000178820 119 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp10bB1AWN4 n-R5s144-201ENSMUST00000178859 119 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp10bB1AWN4 n-R5s139-201ENSMUST00000178975 119 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp10bB1AWN4 n-R5s134-201ENSMUST00000178983 119 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp10bB1AWN4 n-R5s136-201ENSMUST00000179080 119 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp10bB1AWN4 Gm25018-201ENSMUST00000179081 119 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp10bB1AWN4 n-R5s104-201ENSMUST00000179107 119 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp10bB1AWN4 n-R5s113-201ENSMUST00000179143 119 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp10bB1AWN4 n-R5s133-201ENSMUST00000179275 119 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp10bB1AWN4 n-R5s117-201ENSMUST00000179431 119 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp10bB1AWN4 Gm25212-201ENSMUST00000179432 119 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp10bB1AWN4 n-R5s138-201ENSMUST00000179476 119 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp10bB1AWN4 n-R5s122-201ENSMUST00000179500 119 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp10bB1AWN4 n-R5s143-201ENSMUST00000179542 119 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp10bB1AWN4 n-R5s107-201ENSMUST00000179704 119 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp10bB1AWN4 Gm26391-201ENSMUST00000179843 119 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp10bB1AWN4 n-R5s110-201ENSMUST00000179995 119 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp10bB1AWN4 n-R5s128-201ENSMUST00000180096 119 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp10bB1AWN4 n-R5s124-201ENSMUST00000180334 119 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp10bB1AWN4 Gm5335-201ENSMUST00000182995 1000 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp10bB1AWN4 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp10bB1AWN4 Cklf-210ENSMUST00000212939 737 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp10bB1AWN4 Tpi-rs4-201ENSMUST00000213734 720 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp10bB1AWN4 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp10bB1AWN4 Hist1h2bl-201ENSMUST00000091756 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp10bB1AWN4 Gm24089-201ENSMUST00000093696 109 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp10bB1AWN4 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp10bB1AWN4 Anxa3-205ENSMUST00000198631 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp10bB1AWN4 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp10bB1AWN4 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp10bB1AWN4 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp10bB1AWN4 AC022682.1-201ENSMUST00000224624 2023 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp10bB1AWN4 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp10bB1AWN4 Il33-201ENSMUST00000025724 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp10bB1AWN4 Hist1h2be-201ENSMUST00000051091 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp10bB1AWN4 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp10bB1AWN4 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp10bB1AWN4 Fopnl-202ENSMUST00000120707 1414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp10bB1AWN4 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp10bB1AWN4 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp10bB1AWN4 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms