Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1X4

Ilf3, Interleukin enhancer-binding factor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ilf3Q9Z1X4 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ilf3Q9Z1X4 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ilf3Q9Z1X4 Ank1-204ENSMUST00000117270 5652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ilf3Q9Z1X4 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ilf3Q9Z1X4 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ilf3Q9Z1X4 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ilf3Q9Z1X4 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ilf3Q9Z1X4 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ilf3Q9Z1X4 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ilf3Q9Z1X4 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ilf3Q9Z1X4 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ilf3Q9Z1X4 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ilf3Q9Z1X4 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ilf3Q9Z1X4 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ilf3Q9Z1X4 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ilf3Q9Z1X4 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ilf3Q9Z1X4 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ilf3Q9Z1X4 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ilf3Q9Z1X4 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ilf3Q9Z1X4 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ilf3Q9Z1X4 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ilf3Q9Z1X4 Fgl2-201ENSMUST00000035799 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ilf3Q9Z1X4 Tubgcp6-201ENSMUST00000041656 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ilf3Q9Z1X4 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ilf3Q9Z1X4 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ilf3Q9Z1X4 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ilf3Q9Z1X4 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ilf3Q9Z1X4 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ilf3Q9Z1X4 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ilf3Q9Z1X4 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ilf3Q9Z1X4 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ilf3Q9Z1X4 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ilf3Q9Z1X4 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ilf3Q9Z1X4 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ilf3Q9Z1X4 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ilf3Q9Z1X4 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ilf3Q9Z1X4 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ilf3Q9Z1X4 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ilf3Q9Z1X4 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ilf3Q9Z1X4 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ilf3Q9Z1X4 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ilf3Q9Z1X4 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ilf3Q9Z1X4 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ilf3Q9Z1X4 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ilf3Q9Z1X4 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ilf3Q9Z1X4 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ilf3Q9Z1X4 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ilf3Q9Z1X4 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ilf3Q9Z1X4 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ilf3Q9Z1X4 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ilf3Q9Z1X4 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ilf3Q9Z1X4 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ilf3Q9Z1X4 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ilf3Q9Z1X4 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ilf3Q9Z1X4 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ilf3Q9Z1X4 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ilf3Q9Z1X4 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ilf3Q9Z1X4 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ilf3Q9Z1X4 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ilf3Q9Z1X4 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ilf3Q9Z1X4 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ilf3Q9Z1X4 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ilf3Q9Z1X4 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ilf3Q9Z1X4 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ilf3Q9Z1X4 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ilf3Q9Z1X4 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ilf3Q9Z1X4 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ilf3Q9Z1X4 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ilf3Q9Z1X4 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ilf3Q9Z1X4 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ilf3Q9Z1X4 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ilf3Q9Z1X4 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ilf3Q9Z1X4 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ilf3Q9Z1X4 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ilf3Q9Z1X4 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ilf3Q9Z1X4 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ilf3Q9Z1X4 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ilf3Q9Z1X4 Unc79-202ENSMUST00000101099 8874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ilf3Q9Z1X4 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ilf3Q9Z1X4 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ilf3Q9Z1X4 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ilf3Q9Z1X4 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ilf3Q9Z1X4 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ilf3Q9Z1X4 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ilf3Q9Z1X4 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ilf3Q9Z1X4 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ilf3Q9Z1X4 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ilf3Q9Z1X4 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ilf3Q9Z1X4 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ilf3Q9Z1X4 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ilf3Q9Z1X4 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ilf3Q9Z1X4 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ilf3Q9Z1X4 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ilf3Q9Z1X4 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ilf3Q9Z1X4 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ilf3Q9Z1X4 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ilf3Q9Z1X4 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ilf3Q9Z1X4 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ilf3Q9Z1X4 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ilf3Q9Z1X4 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms