Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S4

Cldn13, Claudin-13, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn13Q9Z0S4 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.3 ms