Protein–RNA interactions for Protein: Q9R061

Nubp2, Cytosolic Fe-S cluster assembly factor NUBP2, mousemouse

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Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nubp2Q9R061 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Nubp2Q9R061 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Nubp2Q9R061 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Nubp2Q9R061 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Nubp2Q9R061 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Nubp2Q9R061 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Nubp2Q9R061 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Nubp2Q9R061 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Nubp2Q9R061 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Nubp2Q9R061 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Nubp2Q9R061 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Nubp2Q9R061 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Nubp2Q9R061 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Nubp2Q9R061 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Nubp2Q9R061 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Nubp2Q9R061 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Nubp2Q9R061 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Nubp2Q9R061 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Nubp2Q9R061 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Nubp2Q9R061 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Nubp2Q9R061 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Nubp2Q9R061 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Nubp2Q9R061 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Nubp2Q9R061 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Nubp2Q9R061 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Nubp2Q9R061 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Nubp2Q9R061 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Nubp2Q9R061 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Nubp2Q9R061 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Nubp2Q9R061 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Nubp2Q9R061 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Nubp2Q9R061 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Nubp2Q9R061 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Nubp2Q9R061 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Nubp2Q9R061 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Nubp2Q9R061 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Nubp2Q9R061 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Nubp2Q9R061 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Nubp2Q9R061 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Nubp2Q9R061 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Nubp2Q9R061 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Nubp2Q9R061 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Nubp2Q9R061 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Nubp2Q9R061 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Nubp2Q9R061 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Nubp2Q9R061 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Nubp2Q9R061 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Nubp2Q9R061 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Nubp2Q9R061 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Nubp2Q9R061 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Nubp2Q9R061 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Nubp2Q9R061 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Nubp2Q9R061 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Nubp2Q9R061 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Nubp2Q9R061 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Nubp2Q9R061 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Nubp2Q9R061 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Nubp2Q9R061 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Nubp2Q9R061 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Nubp2Q9R061 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Nubp2Q9R061 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Nubp2Q9R061 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Nubp2Q9R061 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Nubp2Q9R061 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Nubp2Q9R061 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Nubp2Q9R061 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Nubp2Q9R061 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Nubp2Q9R061 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Nubp2Q9R061 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Nubp2Q9R061 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Nubp2Q9R061 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Nubp2Q9R061 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Nubp2Q9R061 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Nubp2Q9R061 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Nubp2Q9R061 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Nubp2Q9R061 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Nubp2Q9R061 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Nubp2Q9R061 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Nubp2Q9R061 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Nubp2Q9R061 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Nubp2Q9R061 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Nubp2Q9R061 Gm37580-201ENSMUST00000192408 2800 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Nubp2Q9R061 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Nubp2Q9R061 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Nubp2Q9R061 9230105E05Rik-201ENSMUST00000161291 2250 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Nubp2Q9R061 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Nubp2Q9R061 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Nubp2Q9R061 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Nubp2Q9R061 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Nubp2Q9R061 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Nubp2Q9R061 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Nubp2Q9R061 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Nubp2Q9R061 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Nubp2Q9R061 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Nubp2Q9R061 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Nubp2Q9R061 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Nubp2Q9R061 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Nubp2Q9R061 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Nubp2Q9R061 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Nubp2Q9R061 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
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