Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB3

Ybx3, Y-box-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 361 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ybx3Q9JKB3 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.02
Ybx3Q9JKB3 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ybx3Q9JKB3 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ybx3Q9JKB3 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ybx3Q9JKB3 Gm10614-201ENSMUST00000181414 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ybx3Q9JKB3 Gm7168-201ENSMUST00000088809 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ybx3Q9JKB3 Itpa-201ENSMUST00000103193 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ybx3Q9JKB3 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ybx3Q9JKB3 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ybx3Q9JKB3 Aldoa-202ENSMUST00000087566 1549 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ybx3Q9JKB3 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ybx3Q9JKB3 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ybx3Q9JKB3 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ybx3Q9JKB3 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ybx3Q9JKB3 Gm13426-201ENSMUST00000117887 795 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ybx3Q9JKB3 Olfr29-ps1-201ENSMUST00000117959 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ybx3Q9JKB3 Gm26918-201ENSMUST00000182496 728 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ybx3Q9JKB3 Thy1-205ENSMUST00000215156 460 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ybx3Q9JKB3 Hsd17b3-201ENSMUST00000039832 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ybx3Q9JKB3 4930553M12Rik-201ENSMUST00000057837 498 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ybx3Q9JKB3 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ybx3Q9JKB3 Kif22-ps-201ENSMUST00000119302 1984 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ybx3Q9JKB3 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ybx3Q9JKB3 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ybx3Q9JKB3 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ybx3Q9JKB3 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ybx3Q9JKB3 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ybx3Q9JKB3 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ybx3Q9JKB3 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ybx3Q9JKB3 Asgr1-202ENSMUST00000092959 1308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ybx3Q9JKB3 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ybx3Q9JKB3 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ybx3Q9JKB3 Ikzf2-204ENSMUST00000188110 1365 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ybx3Q9JKB3 Ikzf2-208ENSMUST00000190855 1359 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ybx3Q9JKB3 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ybx3Q9JKB3 Prf1-201ENSMUST00000035419 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ybx3Q9JKB3 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ybx3Q9JKB3 Cd300ld5-201ENSMUST00000100239 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ybx3Q9JKB3 Cd300ld4-201ENSMUST00000100240 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ybx3Q9JKB3 Hist1h4i-201ENSMUST00000102977 727 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ybx3Q9JKB3 2300003K06Rik-201ENSMUST00000105054 1265 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ybx3Q9JKB3 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ybx3Q9JKB3 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ybx3Q9JKB3 Gm6471-202ENSMUST00000148734 587 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ybx3Q9JKB3 Gm12426-201ENSMUST00000153083 371 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ybx3Q9JKB3 Eif5a-212ENSMUST00000153652 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ybx3Q9JKB3 Mir1941-201ENSMUST00000157834 83 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ybx3Q9JKB3 Gm20441-201ENSMUST00000173512 756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ybx3Q9JKB3 Mrgprb7-ps-201ENSMUST00000190238 964 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ybx3Q9JKB3 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ybx3Q9JKB3 Gm4032-203ENSMUST00000211600 531 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ybx3Q9JKB3 AC140314.1-201ENSMUST00000219549 554 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ybx3Q9JKB3 AC154461.1-201ENSMUST00000224207 1005 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ybx3Q9JKB3 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ybx3Q9JKB3 Clrn1-201ENSMUST00000051408 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ybx3Q9JKB3 Gm5278-201ENSMUST00000055957 552 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ybx3Q9JKB3 Cd300ld3-201ENSMUST00000092459 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ybx3Q9JKB3 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ybx3Q9JKB3 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ybx3Q9JKB3 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ybx3Q9JKB3 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ybx3Q9JKB3 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ybx3Q9JKB3 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ybx3Q9JKB3 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ybx3Q9JKB3 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ybx3Q9JKB3 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ybx3Q9JKB3 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ybx3Q9JKB3 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ybx3Q9JKB3 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ybx3Q9JKB3 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ybx3Q9JKB3 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ybx3Q9JKB3 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ybx3Q9JKB3 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ybx3Q9JKB3 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ybx3Q9JKB3 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ybx3Q9JKB3 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ybx3Q9JKB3 Upp1-202ENSMUST00000101525 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ybx3Q9JKB3 Fthl17-ps2-201ENSMUST00000122268 528 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ybx3Q9JKB3 Spata3-205ENSMUST00000130504 1100 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ybx3Q9JKB3 Cfap100-204ENSMUST00000134224 849 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ybx3Q9JKB3 Aamdc-206ENSMUST00000136757 789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ybx3Q9JKB3 C330019F10Rik-201ENSMUST00000149428 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ybx3Q9JKB3 Gm8601-201ENSMUST00000182096 909 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ybx3Q9JKB3 Gm38103-201ENSMUST00000191707 864 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ybx3Q9JKB3 Gm43564-201ENSMUST00000196185 211 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ybx3Q9JKB3 Gm43460-201ENSMUST00000202491 1057 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ybx3Q9JKB3 Gm7183-201ENSMUST00000213870 1005 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ybx3Q9JKB3 Gm34973-201ENSMUST00000217087 572 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ybx3Q9JKB3 Gm12248-203ENSMUST00000219877 1160 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ybx3Q9JKB3 AC154589.2-201ENSMUST00000228847 251 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ybx3Q9JKB3 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ybx3Q9JKB3 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ybx3Q9JKB3 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ybx3Q9JKB3 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ybx3Q9JKB3 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ybx3Q9JKB3 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ybx3Q9JKB3 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ybx3Q9JKB3 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ybx3Q9JKB3 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ybx3Q9JKB3 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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