Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAP7

Asf1b, Histone chaperone ASF1B, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Asf1bQ9DAP7 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Asf1bQ9DAP7 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Asf1bQ9DAP7 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Asf1bQ9DAP7 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Asf1bQ9DAP7 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Asf1bQ9DAP7 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Asf1bQ9DAP7 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Asf1bQ9DAP7 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Asf1bQ9DAP7 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Asf1bQ9DAP7 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Asf1bQ9DAP7 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Asf1bQ9DAP7 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Asf1bQ9DAP7 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Asf1bQ9DAP7 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Asf1bQ9DAP7 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Asf1bQ9DAP7 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Asf1bQ9DAP7 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Asf1bQ9DAP7 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Asf1bQ9DAP7 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Asf1bQ9DAP7 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Asf1bQ9DAP7 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Asf1bQ9DAP7 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Asf1bQ9DAP7 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Asf1bQ9DAP7 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Asf1bQ9DAP7 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Asf1bQ9DAP7 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Asf1bQ9DAP7 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Asf1bQ9DAP7 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Asf1bQ9DAP7 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Asf1bQ9DAP7 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Asf1bQ9DAP7 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Asf1bQ9DAP7 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Asf1bQ9DAP7 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Asf1bQ9DAP7 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Asf1bQ9DAP7 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Asf1bQ9DAP7 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Asf1bQ9DAP7 AC131586.1-201ENSMUST00000228844 2964 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Asf1bQ9DAP7 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Asf1bQ9DAP7 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Asf1bQ9DAP7 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Asf1bQ9DAP7 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Asf1bQ9DAP7 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Asf1bQ9DAP7 Gm37368-201ENSMUST00000193173 3212 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Asf1bQ9DAP7 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Asf1bQ9DAP7 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Asf1bQ9DAP7 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Asf1bQ9DAP7 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Asf1bQ9DAP7 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Asf1bQ9DAP7 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Asf1bQ9DAP7 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Asf1bQ9DAP7 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Asf1bQ9DAP7 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Asf1bQ9DAP7 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Asf1bQ9DAP7 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Asf1bQ9DAP7 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Asf1bQ9DAP7 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Asf1bQ9DAP7 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Asf1bQ9DAP7 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Asf1bQ9DAP7 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Asf1bQ9DAP7 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Asf1bQ9DAP7 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Asf1bQ9DAP7 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Asf1bQ9DAP7 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Asf1bQ9DAP7 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Asf1bQ9DAP7 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Asf1bQ9DAP7 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Asf1bQ9DAP7 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Asf1bQ9DAP7 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Asf1bQ9DAP7 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Asf1bQ9DAP7 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Asf1bQ9DAP7 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Asf1bQ9DAP7 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Asf1bQ9DAP7 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Asf1bQ9DAP7 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Asf1bQ9DAP7 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Asf1bQ9DAP7 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Asf1bQ9DAP7 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Asf1bQ9DAP7 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Asf1bQ9DAP7 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Asf1bQ9DAP7 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Asf1bQ9DAP7 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Asf1bQ9DAP7 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Asf1bQ9DAP7 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Asf1bQ9DAP7 Enam-201ENSMUST00000031222 5483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Asf1bQ9DAP7 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Asf1bQ9DAP7 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Asf1bQ9DAP7 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Asf1bQ9DAP7 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Asf1bQ9DAP7 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Asf1bQ9DAP7 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Asf1bQ9DAP7 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Asf1bQ9DAP7 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Asf1bQ9DAP7 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Asf1bQ9DAP7 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Asf1bQ9DAP7 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Asf1bQ9DAP7 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Asf1bQ9DAP7 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Asf1bQ9DAP7 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Asf1bQ9DAP7 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Asf1bQ9DAP7 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.6 ms