Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAL0

Smim23, Small integral membrane protein 23, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim23Q9DAL0 Arfgap3-202ENSMUST00000226124 2461 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Smim23Q9DAL0 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Smim23Q9DAL0 Supt16-201ENSMUST00000046709 4673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Smim23Q9DAL0 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Smim23Q9DAL0 Zfp959-201ENSMUST00000054780 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Smim23Q9DAL0 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Smim23Q9DAL0 Unkl-201ENSMUST00000015271 3414 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Smim23Q9DAL0 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Smim23Q9DAL0 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Smim23Q9DAL0 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Smim23Q9DAL0 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Smim23Q9DAL0 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Smim23Q9DAL0 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Smim23Q9DAL0 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Smim23Q9DAL0 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Smim23Q9DAL0 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Smim23Q9DAL0 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Smim23Q9DAL0 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Smim23Q9DAL0 4930488L21Rik-202ENSMUST00000212638 3164 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Smim23Q9DAL0 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Smim23Q9DAL0 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Smim23Q9DAL0 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Smim23Q9DAL0 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Smim23Q9DAL0 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Smim23Q9DAL0 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Smim23Q9DAL0 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Smim23Q9DAL0 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Smim23Q9DAL0 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Smim23Q9DAL0 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Smim23Q9DAL0 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Smim23Q9DAL0 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Smim23Q9DAL0 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Smim23Q9DAL0 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Smim23Q9DAL0 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Smim23Q9DAL0 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Smim23Q9DAL0 Ipo4-201ENSMUST00000047131 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Smim23Q9DAL0 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Smim23Q9DAL0 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Smim23Q9DAL0 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Smim23Q9DAL0 Nf2-202ENSMUST00000056290 2394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Smim23Q9DAL0 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Smim23Q9DAL0 Hsd3b5-201ENSMUST00000044094 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Smim23Q9DAL0 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Smim23Q9DAL0 A730018C14Rik-201ENSMUST00000050754 2253 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Smim23Q9DAL0 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Smim23Q9DAL0 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Smim23Q9DAL0 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Smim23Q9DAL0 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Smim23Q9DAL0 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Smim23Q9DAL0 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Smim23Q9DAL0 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Smim23Q9DAL0 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Smim23Q9DAL0 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Smim23Q9DAL0 Ifit1bl1-202ENSMUST00000168254 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Smim23Q9DAL0 Gm42450-201ENSMUST00000199286 2644 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim23Q9DAL0 4933408B17Rik-201ENSMUST00000056932 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim23Q9DAL0 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim23Q9DAL0 Krba1-201ENSMUST00000031815 3685 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim23Q9DAL0 Oprl1-205ENSMUST00000108768 2914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim23Q9DAL0 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim23Q9DAL0 Pck2-207ENSMUST00000226519 4625 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim23Q9DAL0 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim23Q9DAL0 Tesk2-202ENSMUST00000106456 2430 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim23Q9DAL0 Cyp7b1-201ENSMUST00000035625 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim23Q9DAL0 Uaca-202ENSMUST00000214354 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim23Q9DAL0 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim23Q9DAL0 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim23Q9DAL0 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim23Q9DAL0 Kcnip3-203ENSMUST00000103215 2732 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim23Q9DAL0 Kcnip3-201ENSMUST00000028850 2728 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim23Q9DAL0 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim23Q9DAL0 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim23Q9DAL0 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim23Q9DAL0 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim23Q9DAL0 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim23Q9DAL0 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim23Q9DAL0 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim23Q9DAL0 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim23Q9DAL0 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim23Q9DAL0 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim23Q9DAL0 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim23Q9DAL0 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim23Q9DAL0 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim23Q9DAL0 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim23Q9DAL0 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim23Q9DAL0 D930048N14Rik-202ENSMUST00000117859 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim23Q9DAL0 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim23Q9DAL0 A930006I01Rik-201ENSMUST00000139065 2229 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim23Q9DAL0 Arhgap24-204ENSMUST00000112852 2783 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim23Q9DAL0 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim23Q9DAL0 Zscan12-203ENSMUST00000225545 4405 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim23Q9DAL0 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim23Q9DAL0 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim23Q9DAL0 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim23Q9DAL0 Hmg20a-205ENSMUST00000215269 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim23Q9DAL0 Prdx6b-201ENSMUST00000057072 2885 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim23Q9DAL0 Fbxo40-201ENSMUST00000075869 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim23Q9DAL0 Wbp1l-202ENSMUST00000111855 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim23Q9DAL0 Apba2-201ENSMUST00000032732 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim23Q9DAL0 Camta2-201ENSMUST00000036299 4495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.3 ms