Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0D5

Gtf2e1, General transcription factor IIE subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e1Q9D0D5 Gm37826-201ENSMUST00000195329 322 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gtf2e1Q9D0D5 Gm42518-201ENSMUST00000196277 938 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gtf2e1Q9D0D5 Gm31166-202ENSMUST00000210638 1268 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gtf2e1Q9D0D5 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gtf2e1Q9D0D5 Rab30-202ENSMUST00000107179 1304 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gtf2e1Q9D0D5 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gtf2e1Q9D0D5 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gtf2e1Q9D0D5 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gtf2e1Q9D0D5 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gtf2e1Q9D0D5 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gtf2e1Q9D0D5 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gtf2e1Q9D0D5 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gtf2e1Q9D0D5 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gtf2e1Q9D0D5 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gtf2e1Q9D0D5 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gtf2e1Q9D0D5 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gtf2e1Q9D0D5 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gtf2e1Q9D0D5 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gtf2e1Q9D0D5 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gtf2e1Q9D0D5 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gtf2e1Q9D0D5 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gtf2e1Q9D0D5 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gtf2e1Q9D0D5 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gtf2e1Q9D0D5 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gtf2e1Q9D0D5 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gtf2e1Q9D0D5 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gtf2e1Q9D0D5 Polr2i-203ENSMUST00000108193 488 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gtf2e1Q9D0D5 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gtf2e1Q9D0D5 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gtf2e1Q9D0D5 Smim1-204ENSMUST00000130175 477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gtf2e1Q9D0D5 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gtf2e1Q9D0D5 Gm14236-201ENSMUST00000142374 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gtf2e1Q9D0D5 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gtf2e1Q9D0D5 Gm25072-201ENSMUST00000175233 235 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gtf2e1Q9D0D5 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gtf2e1Q9D0D5 Gm8531-201ENSMUST00000188319 893 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gtf2e1Q9D0D5 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gtf2e1Q9D0D5 Gm31401-201ENSMUST00000207352 734 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gtf2e1Q9D0D5 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gtf2e1Q9D0D5 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gtf2e1Q9D0D5 CT025553.1-201ENSMUST00000226292 299 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gtf2e1Q9D0D5 AC102368.1-201ENSMUST00000227161 892 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gtf2e1Q9D0D5 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gtf2e1Q9D0D5 Gm6655-201ENSMUST00000201932 1309 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gtf2e1Q9D0D5 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gtf2e1Q9D0D5 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gtf2e1Q9D0D5 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gtf2e1Q9D0D5 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gtf2e1Q9D0D5 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gtf2e1Q9D0D5 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gtf2e1Q9D0D5 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gtf2e1Q9D0D5 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gtf2e1Q9D0D5 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gtf2e1Q9D0D5 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gtf2e1Q9D0D5 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gtf2e1Q9D0D5 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gtf2e1Q9D0D5 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gtf2e1Q9D0D5 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gtf2e1Q9D0D5 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gtf2e1Q9D0D5 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gtf2e1Q9D0D5 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gtf2e1Q9D0D5 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gtf2e1Q9D0D5 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gtf2e1Q9D0D5 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gtf2e1Q9D0D5 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gtf2e1Q9D0D5 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gtf2e1Q9D0D5 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gtf2e1Q9D0D5 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gtf2e1Q9D0D5 Gm12795-201ENSMUST00000117594 539 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gtf2e1Q9D0D5 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gtf2e1Q9D0D5 Gm15549-201ENSMUST00000121595 622 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gtf2e1Q9D0D5 Gad1-207ENSMUST00000148210 1021 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gtf2e1Q9D0D5 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gtf2e1Q9D0D5 Gm24398-201ENSMUST00000157870 109 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gtf2e1Q9D0D5 1600010M07Rik-202ENSMUST00000188662 654 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gtf2e1Q9D0D5 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gtf2e1Q9D0D5 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gtf2e1Q9D0D5 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gtf2e1Q9D0D5 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gtf2e1Q9D0D5 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gtf2e1Q9D0D5 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gtf2e1Q9D0D5 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gtf2e1Q9D0D5 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gtf2e1Q9D0D5 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gtf2e1Q9D0D5 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gtf2e1Q9D0D5 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gtf2e1Q9D0D5 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gtf2e1Q9D0D5 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gtf2e1Q9D0D5 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gtf2e1Q9D0D5 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gtf2e1Q9D0D5 Gm4900-201ENSMUST00000222046 1628 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gtf2e1Q9D0D5 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gtf2e1Q9D0D5 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gtf2e1Q9D0D5 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gtf2e1Q9D0D5 Bri3-202ENSMUST00000110695 669 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gtf2e1Q9D0D5 Gm15329-201ENSMUST00000121408 155 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gtf2e1Q9D0D5 Treml4-202ENSMUST00000125426 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gtf2e1Q9D0D5 1700122E12Rik-202ENSMUST00000147538 479 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gtf2e1Q9D0D5 Tro-208ENSMUST00000164071 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gtf2e1Q9D0D5 Gm28324-201ENSMUST00000187913 264 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.3 ms